[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Streptomyces avermitilis MA-4680 (save0)
Gene : BAC68352.1
DDBJ      :             putative membrane protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  7/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1
:1077 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   134->313 2a5yB PDBj 2e-05 9.7 %
:RPS:SCOP  154->384 1n25A  c.37.1.20 * 3e-05 10.2 %
:HMM:SCOP  150->346 1jbkA_ c.37.1.20 * 1.3e-09 21.0 %
:RPS:PFM   190->225 PF06068 * TIP49 2e-04 50.0 %
:HMM:PFM   195->349 PF05729 * NACHT 1.7e-13 24.2 149/166  
:HMM:PFM   61->120 PF07332 * DUF1469 0.0001 35.2 54/121  
:BLT:SWISS 144->228 DNAB_LEIXX 2e-04 33.3 %
:BLT:SWISS 344->468 TORA_ECOLI 9e-05 33.0 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAC68352.1 GT:GENE BAC68352.1 GT:PRODUCT putative membrane protein GT:DATABASE GIB00135CH01 GT:ORG save0 GB:ACCESSION GIB00135CH01 GB:LOCATION complement(798051..801284) GB:FROM 798051 GB:TO 801284 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT putative membrane protein GB:NOTE PF05729: NACHT domain GB:PROTEIN_ID BAC68352.1 LENGTH 1077 SQ:AASEQ MRGPRGQWFARRFGRVPHTVVNRMDGGYVENLIQAGAIHGGVHFHVHRPESPQIHGLLRPVAVLFLALAAVALIVSDLGRRRPGPAWTVAACLLVVAAYLGVAHVRARRGRRGVFSERQLDIAATQLAGRLRTMYDREERLSRVHDPIPLRVRWSEGDPELVDHWENISRDSGQIPDIEGEFAEINEVYKRIPSRRLVVLGPPGGGKSALALRFARQALKGSPVPVIFPLASWDPRQQGLWQWAAALVSDRHPSLAARGAQRRAIAQALLETGRILPVLDGFDEIPTVTQATALAEFNASLGRDACFVLTSRSTAFEQAVAQSDVLTATAVVELERLTVDQLAEYLPRTSRKVKSGEGTLTTWDPVLARLGEEDGQARHVRRALSTPLMVGLARAAYSDTRADPMELLDPRQFPDSSAIEAHLFDRFIPSVYGGALADRTWEAEQAGIWLRFLARHVRAGGTQELEWWRLDTTTPRWVGWLAFVPLIAAITGVTYWSGLGEAHATFWPGGPIWLTEALLFLALLTTVWFATDPSAFPGPKHVRGSRALPFLRSEPSDTESVSSPWELLRRDRTAAWVKGAFWVLPFKERGGPLDLFSLALFLILPITWLWQSNIDILEPEQNVGRVTLLLNTFAWLLYEVGGSAWGRFNVARIWLAATGRLPWRLGAFLQDAHGRGVLRQSGGRYRFRHLELLNRLAGKDFSQRKKHSLRIRRLAFVVHMVIWVGLVAWLLAAAENAIGPSGPYSSVAPACSLLRGEQLEPAITDPWARADGSGRCHWTEQAPFNRDGEVTLSVTVARPGNGVSAVMVADRQLNVVSTLELAGVGDRAVISPRENEPGSAGWSARVGARTGNVFVDLTYTEVARDGQRVKAVAAILVRQVLANAGLGESPGTALVAVPRPPLPGDAPYTRYRRGVARSIDGPVWRPGDRSQLNGIQSLPFVFRGPRMSCAMQWICGIGILGHPRPVYGIIVFDLRECTGGPCSRRTIDGYVRDPKNKHAAGAPWKWADASTKIADFSCSRKPSKEWPDQNDLHCVEMVRAFRIGGKDYLLGLRTAVAKQHADLMRKTVNDIYTQTGG GT:EXON 1|1-1077:0| BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 144->228|DNAB_LEIXX|2e-04|33.3|81/457| BL:SWS:REP 344->468|TORA_ECOLI|9e-05|33.0|115/848| TM:NTM 6 TM:REGION 56->78| TM:REGION 87->104| TM:REGION 475->497| TM:REGION 510->531| TM:REGION 591->613| TM:REGION 714->736| SEG 57->78|llrpvavlflalaavalivsdl| SEG 89->114|vaacllvvaaylgvahvrarrgrrgv| SEG 255->270|laargaqrraiaqall| SEG 513->531|wlteallflallttvwfat| SEG 592->606|pldlfslalflilpi| SEG 723->734|wvglvawllaaa| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 134->313|2a5yB|2e-05|9.7|176/501| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 190->225|PF06068|2e-04|50.0|34/394|TIP49| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 195->349|PF05729|1.7e-13|24.2|149/166|NACHT| HM:PFM:REP 61->120|PF07332|0.0001|35.2|54/121|DUF1469| GO:PFM:NREP 2 GO:PFM GO:0003678|"GO:DNA helicase activity"|PF06068|IPR010339| GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF06068|IPR010339| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 154->384|1n25A|3e-05|10.2|225/362|c.37.1.20| HM:SCP:REP 150->346|1jbkA_|1.3e-09|21.0|176/195|c.37.1.20|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 11 OP:NHOMOORG 7 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ----1------------------------------------1-2----------------1---2--3------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 176 STR:RPRED 16.3 SQ:SECSTR #####################################################################################################################################HHHHHHHHHHcTT####cHHHHTTTTcccHHHHHHHHHHTTcccccccHHHHHHHHHHHcccEEEEEEccTTcHHHHHHHHHHHcccTcTTTccEEEEEEccTTHHHHHHHHHHHHHTTTcccTTccccTTccHHHHHHHHHHHHTTcTTEEEEEEEEccHHHHHHHHHTTcEEEEEEcc############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################ DISOP:02AL 1-5, 108-115, 557-560, 832-840, 1022-1025, 1076-1077| PSIPRED cccccccHHHHHHccccHHHHHccccHHHHHHHHHccccccEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEcccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHcccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccccHHHHHHcccccccccEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHccHHHHHHHHHHEEEcHHccccEEEHHHHHHHHHcccHHHHccccccccccccccEEEEHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHccHHHHcccEEEHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccEEEcccccccccccEEEEEEEEccccccEEEEEEcccccHHHHHHHccccccEEEccccccccccccccccccccccEEEEEEHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHccHHcccHHcccccHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEEEEEHHcccccccccccccHHccccccccccccccccccccEEEcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccc //