[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Streptomyces avermitilis MA-4680 (save0)
Gene : cvnA2
DDBJ      :cvnA2        putative sensor-like histidine kinase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  39/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.122.1
:850 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   537->660 1i5aA PDBj 1e-04 27.6 %
:RPS:PDB   472->599 3bk9F PDBj 4e-20 11.0 %
:RPS:PDB   586->671 2dvyD PDBj 2e-08 17.4 %
:RPS:SCOP  539->671 1bxdA  d.122.1.3 * 2e-08 23.7 %
:HMM:SCOP  558->679 1kijA2 d.122.1.2 * 1.8e-19 31.4 %
:RPS:PFM   162->338 PF08376 * NIT 6e-05 27.8 %
:RPS:PFM   577->671 PF02518 * HATPase_c 5e-07 30.5 %
:HMM:PFM   110->357 PF08376 * NIT 1.9e-42 22.9 245/247  
:HMM:PFM   575->679 PF02518 * HATPase_c 4.6e-15 26.9 104/111  
:HMM:PFM   372->454 PF00672 * HAMP 5e-06 25.8 66/70  
:BLT:SWISS 537->671 BPHY_DEIRA 1e-06 27.8 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAC69293.1 GT:GENE cvnA2 GT:PRODUCT putative sensor-like histidine kinase GT:DATABASE GIB00135CH01 GT:ORG save0 GB:ACCESSION GIB00135CH01 GB:LOCATION complement(1945072..1947624) GB:FROM 1945072 GB:TO 1947624 GB:DIRECTION - GB:GENE cvnA2 GB:PRODUCT putative sensor-like histidine kinase GB:NOTE multi-component regulatory system-2 GB:PROTEIN_ID BAC69293.1 LENGTH 850 SQ:AASEQ MRTSRRTPSAGAEPPSRPPVRGRRAHAGQPADEDTGTDETVTAASADSPVGAGRWGVRPRTVRAKIVCLLMVPVVSLLALWAYATVSTAQDVARLRQVQQVDTTVRAPVAAAVAALQAERAAAVRHVIDPSAEPDSGFRTLAARTDRAVDKLRLGGHHTVADGADLPAQVPGRLETFVSGAEQLRSLRGAVLERRARWDETFGQYTRTIAAAFGVGGALTGIQDADLGSDARVLLEFSRAGEALAQEDAVLSSARLAGTLDGERLRLFTGAVDTRRTLTDSAVADLSERERAAWQGVATGRAYADVRTAEDKVLANRPGARRIAAAPQATWDPAHARVQEGMRTIEADAGRGVADRADPLTRGLLTPAGAAVLFGLAAVAASLVISVRIGRGLVIELISLRNSALEIARRKLPQAMRKLRAGEEIDVRAEAPPGPPAEDETGQVAEALSTVHRAALRAAVERAELASGISGVFVNLARRSQILVHRQLSLLDSMERRSEDPNELSDLFRLDHLTTRMRRHAESLIILSGAAPGRAWRMPVSLTNVVRAAVSEVEDYARVEVRQLPEASVVGAAVADLTHLMAEIVENAAQFSPPHTRVRVTGEPVGNGYAVEVEDRGLGMGKETLAEANRRIEQSEALDLFDSDRLGLFVVSRLAARHGIKVHLRTSPYGGTTAVVLLPTALLHSGTAERVPRAADTGRDAEPAYARVAAASHQSVQQAVGRPALVPPVHAAVEAAPDTTPENPPPGVATLRLHRPPDAEGPEAGEQDDPEGSDDLPRRVRQASLAPQLRRQRPEEPAPHTHGVRDDEERTPELVRDRMAAYRDGWARGGGRSPGRAAGPAGDSSEGDPA GT:EXON 1|1-850:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 537->671|BPHY_DEIRA|1e-06|27.8|133/755| TM:NTM 2 TM:REGION 65->87| TM:REGION 372->394| SEG 105->125|vrapvaaavaalqaeraaavr| SEG 347->358|adagrgvadrad| SEG 368->387|agaavlfglaavaaslvisv| SEG 429->440|aeappgppaede| SEG 453->466|raalraaveraela| SEG 672->683|ttavvllptall| SEG 706->720|arvaaashqsvqqav| SEG 723->737|palvppvhaaveaap| SEG 824->845|dgwargggrspgraagpagdss| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 537->660|1i5aA|1e-04|27.6|123/181| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 472->599|3bk9F|4e-20|11.0|127/250| RP:PDB:REP 586->671|2dvyD|2e-08|17.4|86/214| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 162->338|PF08376|6e-05|27.8|176/246|NIT| RP:PFM:REP 577->671|PF02518|5e-07|30.5|95/112|HATPase_c| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 110->357|PF08376|1.9e-42|22.9|245/247|NIT| HM:PFM:REP 575->679|PF02518|4.6e-15|26.9|104/111|HATPase_c| HM:PFM:REP 372->454|PF00672|5e-06|25.8|66/70|HAMP| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF02518|IPR003594| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 539->671|1bxdA|2e-08|23.7|131/161|d.122.1.3| HM:SCP:REP 558->679|1kijA2|1.8e-19|31.4|121/212|d.122.1.2|1/1|ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase| OP:NHOMO 126 OP:NHOMOORG 39 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ----9----------1111-11--1111111111117122-5462---1-----------64--575CCA6--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 230 STR:RPRED 27.1 SQ:SECSTR #######################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHHHHHHHHTHHHHTTccHHHHHTTTGGGGTTccGGGcHHHHHHHHHHTcccGGGGTTTTTcHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHTccccTTccGGGHHHHHHHHHcTTTTHHHHHHHHEccccTTcccEEEEccTTccETTTcccccccccTTEEEEccccccccTHHHHHHHHHTTTcccHHHHTTHHHEEEEEEEEccTTTccccccccHHHHHHccc##################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-57, 162-167, 496-501, 634-645, 682-850| PSIPRED ccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHccccccccHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEcccccEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEEEcccEEEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEcccccEEEEEEEcHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccc //