[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Streptomyces avermitilis MA-4680 (save0)
Gene : pteR
DDBJ      :pteR         DnrI/RedD/AfsR-family transcriptional regulator
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  1/68 : Bacteria  113/915 : Eukaryota  5/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.118.8a.211.1a.4.6c.37.1
:1197 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   16->268 2ff4B PDBj 8e-15 25.4 %
:RPS:PDB   561->806 2a5yB PDBj 1e-05 14.1 %
:RPS:SCOP  19->112 2fezA1  a.4.6.1 * 2e-04 29.0 %
:RPS:SCOP  114->265 2fezA2  a.118.8.3 * 1e-06 23.7 %
:RPS:SCOP  871->985 1vj7A1  a.211.1.1 * 2e-06 20.0 %
:HMM:SCOP  18->113 2ff4A1 a.4.6.1 * 1.3e-14 39.1 %
:HMM:SCOP  114->292 2ff4A2 a.118.8.3 * 4.3e-36 39.1 %
:HMM:SCOP  408->688 1iqpA2 c.37.1.20 * 2.5e-12 23.9 %
:HMM:SCOP  1030->1153 2ff4A2 a.118.8.3 * 0.00025 21.2 %
:RPS:PFM   119->264 PF03704 * BTAD 2e-14 42.3 %
:HMM:PFM   119->264 PF03704 * BTAD 4.7e-45 50.0 146/146  
:HMM:PFM   41->112 PF00486 * Trans_reg_C 2e-15 35.7 70/77  
:HMM:PFM   1121->1144 PF07721 * TPR_4 8.2e-05 29.2 24/26  
:HMM:PFM   411->460 PF01637 * Arch_ATPase 6.5e-05 29.8 47/234  
:BLT:SWISS 19->269 DNRI_STRPE 4e-34 33.5 %
:BLT:SWISS 542->1110 Y2095_RHIME 1e-09 22.9 %
:PROS 1040->1054|PS00678|WD_REPEATS_1
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAC68120.2 GT:GENE pteR GT:PRODUCT DnrI/RedD/AfsR-family transcriptional regulator GT:DATABASE GIB00135CH01 GT:ORG save0 GB:ACCESSION GIB00135CH01 GB:LOCATION 490599..494192 GB:FROM 490599 GB:TO 494192 GB:DIRECTION + GB:GENE pteR GB:PRODUCT DnrI/RedD/AfsR-family transcriptional regulator GB:NOTE filipin gene cluster, PF03704: Bacterial transcriptional activator domain, PF07721: Tetratricopeptide repeat GB:PROTEIN_ID BAC68120.2 LENGTH 1197 SQ:AASEQ MPLPPTANASATTTGQAELQLSVLGPMSARLNGHDLPLGPPRRRTLLALLLIRLGRVVPTELLVEELWGDGAPRHAVATLQSYVSHLRRSLHTKAGTGQISVLRHRTPGYVLDLDPEQVDAWRFERLVTDGRRLLEQRDPRTAHARLTEALGLWHGSPYAEFDSHPPLSDECTRLEQIRLTAVESRAEARLALGAAEEVAADLDGEARRHPTRERLVGHLMTALSRLGRQAEALEVYERTRSHLVEEFGVDTAAELRRVRNAILRPGPGASAPSKKLSPTPLESTRASPVPLAMNESGDDGVQNSEGFVGSWDGRTAVTPRRHGTTVETNDANGTDDADAAVEREGITGTGARPEARTDVPPGTRADAAGTQAGTAQWRPAPGPEHELAATPEAGKSPESESGWTAAPSPFTGRSQELDRLTTAAASAVVGHGHVAGVLGPPGVGKTRLLLELAARLESMEAPEKGSRLEVVWSHCFPGEGVPAYWLWTQILRRLSATRPDAFRDATEPFGALLAPLMPERSAARTEGPKGASDWFQARFLAHDAVCEVLLALAGQHPLVLFLEDLQWADTASLDLLRLLSTRCQGHPLSIVLTTRKFEAESDATLRRMVSDVLRGPRTETLQLCGLSLQAVGALVEAHAGSGVDPKVVEVLHRRSGGNPYLVMQLLSLVGDARKLRRPDAVDALLAHIPTGVREALRQRFAGLPEPVLRVLRLCAVIGAEVDTDLLHRTATRDEPVIAGLESAIRAGLLGEDPHHPGRLHFAHALVQETLVDELPREDRHRLHARVADALSARRRGQVQDEEIERVAHHSWHARSALPAAEVLPRLLLAAEHAEQSMAYEQVEIWLRRAVHLVGFLPPDDPATGRLEQDLHIQLGQVLATTRGYGHPEAETALTRGRALSTAAHAPEDPSVLWALCTAYLVTGRYDASRQFSGLLRDISRQTWEPVAALGATYGEGIVLHVRGMLPQALAELERGVGIADRFANKDHGLSRTFQHDPRVSCRSYNTFTHWLLGHRQTAGARRRELLSLTRYESRPSDRSFALYVDGVVAAWEGDTRTALASSDEGARVAGEHGLVYWKAMLGVVKGWGLAHAGDHEDGLALMHTSLAELGQSKTHIRHPLHLGLLGQAQHHGGRIEEARTTFRKLLAAVEQRRERVYLHPALPATPLLHELLGHGADEALTDRGPGRDGPNSGRRA GT:EXON 1|1-1197:0| BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 19->269|DNRI_STRPE|4e-34|33.5|251/272| BL:SWS:REP 542->1110|Y2095_RHIME|1e-09|22.9|542/1029| PROS 1040->1054|PS00678|WD_REPEATS_1|PDOC00574| SEG 36->56|lplgpprrrtllalllirlgr| SEG 186->207|raearlalgaaeevaadldgea| SEG 329->341|tndangtddadaa| SEG 363->376|gtradaagtqagta| SEG 424->445|aaasavvghghvagvlgppgvg| SEG 448->458|rlllelaarle| SEG 1119->1134|hplhlgllgqaqhhgg| SEG 1159->1173|lhpalpatpllhell| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 16->268|2ff4B|8e-15|25.4|252/373| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 561->806|2a5yB|1e-05|14.1|234/501| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 119->264|PF03704|2e-14|42.3|142/142|BTAD| HM:PFM:NREP 4 HM:PFM:REP 119->264|PF03704|4.7e-45|50.0|146/146|BTAD| HM:PFM:REP 41->112|PF00486|2e-15|35.7|70/77|Trans_reg_C| HM:PFM:REP 1121->1144|PF07721|8.2e-05|29.2|24/26|TPR_4| HM:PFM:REP 411->460|PF01637|6.5e-05|29.8|47/234|Arch_ATPase| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 19->112|2fezA1|2e-04|29.0|93/95|a.4.6.1| RP:SCP:REP 114->265|2fezA2|1e-06|23.7|152/179|a.118.8.3| RP:SCP:REP 871->985|1vj7A1|2e-06|20.0|115/172|a.211.1.1| HM:SCP:REP 18->113|2ff4A1|1.3e-14|39.1|92/0|a.4.6.1|1/1|C-terminal effector domain of the bipartite response regulators| HM:SCP:REP 114->292|2ff4A2|4.3e-36|39.1|179/0|a.118.8.3|1/2|TPR-like| HM:SCP:REP 408->688|1iqpA2|2.5e-12|23.9|209/0|c.37.1.20|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| HM:SCP:REP 1030->1153|2ff4A2|0.00025|21.2|118/0|a.118.8.3|2/2|TPR-like| OP:NHOMO 362 OP:NHOMOORG 119 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------1------ --3-O-----------132-22--2223222132223121-94C15------1-------D74-D488AJ2-------------------------1----------1----------------------------23333---6-41-1-----------------6591------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1------------1-1-----------3-1---3--1------------------1---1------211343231--1--------1---------------2-----------------------------------------13----1-------12-----111-2521-----1-1--1-111-11--------------111-----12------------------1-----2P-------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11------------------------------------------------1111------------------------------------------------- -------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------1---18----- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 486 STR:RPRED 40.6 SQ:SECSTR ###############cccEEEEcccccEEEETTEEcccccHHHHHHHHHHHHTTTccEEHHHHHHHHHTTcccTTHHHHHHHHHHHHHHHHGG#GTccHHHHEEEETTEEEEcccGGGcHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHHTccccTTGGGTTcTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHHHcTTcHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHTTcc####################################################################################################################################################################################################################################################################################################HTTcTTEEEEEEEEccH#HHHHHHHHTTcEEEEEEc#####cGGGGGGc######cccEEEEEcccccHHHHHHHHHHTccccccHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHTTcccccHHHHHHHHHHHHHHcccTTccccccccccccHHHHHHTTGGGccTccEEHHHHHHHccccccTHHHHHHTTTcccccEEEcccEEccHHHHHHHTTccTHHHHHHHTTcTTTccccTTcTTcccTTHHHHTc####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-4,6-15,263-293,374-384,396-398,400-403,530-533,1181-1198| PSIPRED ccccccccccccccccccEEEEEcccEEEEEccEEccccccHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccEEEEccccEEEcccHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHcccccccccccccccHHHHHccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHccccEEcccEEEEEEEccHHHcccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccHHHccHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEcccccccccHHHHHHHHHHcccccEEEEcccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHccccEEccccccEEEHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccc //