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Streptomyces avermitilis MA-4680 (save0)
Gene : ttrA1
DDBJ      :ttrA1        putative helicase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  1/68 : Bacteria  50/915 : Eukaryota  1/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1
:875 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   36->81 1wp9D PDBj 8e-04 41.3 %
:RPS:PDB   3->177 1c4oA PDBj 2e-07 20.1 %
:RPS:SCOP  3->104 1m6nA3  c.37.1.19 * 5e-07 22.8 %
:RPS:SCOP  366->452 2fwrA1  c.37.1.19 * 3e-04 27.6 %
:HMM:SCOP  1->208 1z3iX2 c.37.1.19 * 7.4e-25 31.4 %
:HMM:SCOP  165->452 2fwrA1 c.37.1.19 * 2.2e-12 28.9 %
:RPS:PFM   604->640 PF03457 * HA 1e-04 45.9 %
:HMM:PFM   567->640 PF03457 * HA 7.4e-19 36.4 66/68  
:HMM:PFM   641->715 PF03457 * HA 1.3e-15 36.4 66/68  
:HMM:PFM   719->785 PF03457 * HA 4.9e-14 31.2 64/68  
:HMM:PFM   803->872 PF03457 * HA 5.6e-16 36.1 61/68  
:HMM:PFM   2->209 PF04851 * ResIII 6.2e-18 23.3 180/184  
:HMM:PFM   370->447 PF00271 * Helicase_C 4.2e-07 34.3 67/78  
:BLT:SWISS 33->500 VF859_ASFK5 7e-08 30.6 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAC67715.1 GT:GENE ttrA1 GT:PRODUCT putative helicase GT:DATABASE GIB00135CH01 GT:ORG save0 GB:ACCESSION GIB00135CH01 GB:LOCATION 4936..7563 GB:FROM 4936 GB:TO 7563 GB:DIRECTION + GB:GENE ttrA1 GB:PRODUCT putative helicase GB:NOTE PF03457: Helicase associated domain GB:PROTEIN_ID BAC67715.1 LENGTH 875 SQ:AASEQ 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cccccTTHHHHHHHHH##HHHccccHHHHHHHHTTcEcccEEEcTTccHHHHHHHHHTccEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHcTTcEEEEcccGGGTccccEEEGGGTEEEcccccccTTcccHHHHHHHHHHHcccEEEEEEGGGccc#ccH########HHHHHccccccccccccEEEEEEcccTTTccTTcEE#####EEEEEEc########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 503-536, 796-797, 799-800, 852-863| PSIPRED 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