[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 (sent8)
Gene : ACF66375.1
DDBJ      :             host specificity protein J
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  83/915 : Eukaryota  2/199 : Viruses  10/175   --->[See Alignment]
b.1.2c.1.8
:1116 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   602->749 2b4kA PDBj 1e-09 6.2 %
:RPS:SCOP  231->416 1amyA2  c.1.8.1 * 2e-04 6.1 %
:RPS:SCOP  613->715 1bpvA  b.1.2.1 * 6e-08 16.0 %
:RPS:SCOP  710->799 1x5jA1  b.1.2.1 * 8e-06 14.4 %
:HMM:SCOP  606->716 1uc6A_ b.1.2.1 * 4.3e-07 24.3 %
:RPS:PFM   840->920 PF09327 * DUF1983 1e-25 61.7 %
:RPS:PFM   944->1045 PF12421 * DUF3672 8e-10 40.4 %
:HMM:PFM   840->920 PF09327 * DUF1983 1.1e-30 45.7 81/81  
:HMM:PFM   944->1076 PF12421 * DUF3672 1.4e-30 28.5 130/136  
:HMM:PFM   669->708 PF07495 * Y_Y_Y 1e-05 37.5 40/66  
:BLT:SWISS 1->992 VHSJ_LAMBD 0.0 68.4 %

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ACF66375.1 GT:GENE ACF66375.1 GT:PRODUCT host specificity protein J GT:DATABASE GIB00763CH01 GT:ORG sent8 GB:ACCESSION GIB00763CH01 GB:LOCATION 1137695..1141045 GB:FROM 1137695 GB:TO 1141045 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT host specificity protein J GB:NOTE identified by match to protein family HMM PF00041; match to protein family HMM PF09327 GB:PROTEIN_ID ACF66375.1 GB:DB_XREF GI:194406156 LENGTH 1116 SQ:AASEQ MSKGGGKGHTPREAKDDLKSTQQLSVIDALSEGPIVGPVNGLQSVLINNTPVVDADGNSNIHGVTVVYQVGETPQAPLEGFEASGAETVLGVEVKHDNPVTRTVVSENVDRLRFTFGVQMLQETTDKGDRNPSSVNLLIQFQRSGIWNTEFDITINGKITTQYLASVVADNLPPRPFSVRMVRVTPDSTTDRLQNKTLWSSYTEIIDIRQGYPGTAVAGLLVDAEQFGSQQVTRNYHLRGRIFQVPSNYDPDTRTYTGLWDGAFKPAYTNNPAWCTMDKLTHPRYGLGRRIGGADVDKWALYAIAQYCDQPVPDGFGGTEPRMTLNAYITTQRKAYDVLADFCSVMRCMPVWNGRKMTFIQDRPSDKAWTYTNGNVVGGRFKYSFSALKDRHNAIEVRYTDPLNGWQTSTELVEDHASQARYGRNLLKMDAFGCTSRGQAHRTGLWVMMTELLETQTVDFSVGAEGLRHTPGDIIEVCDNDYAGVSVGGRITDLDISTRTLTLDREITLPESGATTLNIVGPDGKPFSTEIQSQPAPDRVVTKVLPETVQPYSIWGLKLPSLKRRLFRCVRIKENDDGTYAITALQHVPEKESIVDNGAHFDPLPGTTNSIIPPAVQHLTVSTDNDSTLYQAKAKWDTPRVVKGVRFVVRLTIRNGKDDDPARLVTTATTSETEYAFHELPLGDYTLTVRAINGFGQQGEPSSVTFSIQAPAAPSTIELTPGYFQITVTPYQAIYDASVQYEFWYSATQLTTAADIQSKAQYLGIGSFWIKDGLKPLHDAWFYVRSVNLAGKSVFAEVSGRPSDDAKGYLDFFKGLITEAYLGTELLKKIDLTEDNASKLQQFSKEWKDANDKWNAMWGVKIEQTKDGKYYVAGIGLSMEDTPDGKISQFLVAADRIAYINPANGNQTPGFVMQGDQIIMNEAFLKYLSAPTITSGGNPPAFSLTPDGKLTAKNADISGHINAVSGSFTGEINATSGKFSGVIEAKEFVGDICGSKVMQGVSIRAKNDERSTSTRYTDSATYQIGKTITVMANCERNGGSGAITVTININGQVKTAEVIPYTAGLPAMYQTVVFSVYTTSPVVDISVSLRVGGQYTTEASVWPLVMVSRSGSNFTN GT:EXON 1|1-1116:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->992|VHSJ_LAMBD|0.0|68.4|990/1132| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 602->749|2b4kA|1e-09|6.2|144/617| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 840->920|PF09327|1e-25|61.7|81/81|DUF1983| RP:PFM:REP 944->1045|PF12421|8e-10|40.4|99/137|DUF3672| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 840->920|PF09327|1.1e-30|45.7|81/81|DUF1983| HM:PFM:REP 944->1076|PF12421|1.4e-30|28.5|130/136|DUF3672| HM:PFM:REP 669->708|PF07495|1e-05|37.5|40/66|Y_Y_Y| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 231->416|1amyA2|2e-04|6.1|179/346|c.1.8.1| RP:SCP:REP 613->715|1bpvA|6e-08|16.0|100/104|b.1.2.1| RP:SCP:REP 710->799|1x5jA1|8e-06|14.4|90/100|b.1.2.1| HM:SCP:REP 606->716|1uc6A_|4.3e-07|24.3|103/0|b.1.2.1|1/1|Fibronectin type III| OP:NHOMO 198 OP:NHOMOORG 95 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1--------------------------7----------------------------------------------1-----------------------------------------------------11-1-2---1-----------1------------------------1-1-------------------------------------1------------------------------------------1------1-1-------------------1---1--CC3-316-1-C1-4134244B44111211-----1-2-1---2-21--13--1-22-2122--1221-2222---------------------1-11-------2-----1----1----112-12-1----2-211-------------1----------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------2------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------1---1-----------------------1111---1-1-----1---------------- STR:NPRED 279 STR:RPRED 25.0 SQ:SECSTR ######################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################EEEcccccEcHHHHHHHcccEEEEEEEEcTTTTGGGcccccccc##cccccEEGGGHHHHEEEEccEEEccccccccccccccHTcTTcEEEEcccccccEEEEEccEEEEEEEEEEEcccEEEEcccccTTcGGGTTcEEEEEEEEEEGGGcccccccccccTTcEEEEEEcccEEEEEEcTTcEEEEEEEccccTTcccccccccccGGGccTTTcccEEEEEEEcGGGcccccccEEEEEEEccEEEEEEEcccccccEEEEEEEEEccccccccccc############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################# DISOP:02AL 1-17,608-614,797-803,1111-1117| PSIPRED cccccccccccEEcccccccEEEEEEEEEEEccccccccccEEEEEEccccccccccccccccEEEEEEccccccccccccccccccEEEEEEEcccccEEEEcccccccEEEEEEEEEEEEEEcccccccEEEEEEEEEEEEcccEEEEEEEEEEEEEcccEEEEEEEEcccccEEEEEEEEEcccccccHHEEEEEEEEEEEEEEcccccccEEEEEEEEEHHHccccccEEEEEEEEEEEEEccccccccccccccccccEEEEccccHHHHHHHHHcccHHcccccccHHHccHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEcccEEEEEEccccccEEEEcHHHEEccEEEEEEEEEcccccEEEEEEEccccccccEEEEEEcccHHHcccccEEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEcccccccccccEEEEccccccccccEEEEEEccccccEEEccccccccccccEEEEEEcccccEEEEEEEEEccccEEEEEEcccccccEEEEEEcccccEEEEEEEEEEEEccccEEEEEEEEccccEEEEEccccccccccccccccccccccccEEEEEcccEEEEEEEEEEcccccccEEEEEEEEEEEccccccEEEEEcccccccEEEEccccccEEEEEEEEEEccccccccEEEEEcccccccccEEEEEccEEEEEEccccccccccEEEEEEEEEccccccccEEEEEEccccccEEEEcccccccEEEEEEEEEEccccccccccEEEccccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEEEEEcccccEEEEEEEEEEEEcccEEEEEEEEEccEEEEEEcccccEEEEEEEEccEEEEEHHHHHcEEEEEEEEccccccEEEcccccEEEEEEEEEEEEEEcccEEEEEEEEccEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEcccEEcccccEEEEEEEcccccccccEEEEEEEEccccccccEEEEEEEEEcccccccEEEcccccccccEEEEEEEEEccccEEEEEEEEEEEEcccccccccEEEEEEccccccc //