[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 (sent8)
Gene : hycC
DDBJ      :hycC         formate hydrogenlyase, subunit C
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  32/68 : Bacteria  536/915 : Eukaryota  2/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:608 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   263->411 2c1wA PDBj 2e-04 7.2 %
:RPS:PFM   154->367 PF00361 * Oxidored_q1 1e-15 34.3 %
:HMM:PFM   124->395 PF00361 * Oxidored_q1 2.8e-39 30.4 260/270  
:BLT:SWISS 1->580 HYCC_ECOLI 0.0 88.8 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ACF69214.1 GT:GENE hycC GT:PRODUCT formate hydrogenlyase, subunit C GT:DATABASE GIB00763CH01 GT:ORG sent8 GB:ACCESSION GIB00763CH01 GB:LOCATION complement(2971058..2972884) GB:FROM 2971058 GB:TO 2972884 GB:DIRECTION - GB:GENE hycC GB:PRODUCT formate hydrogenlyase, subunit C GB:NOTE identified by match to protein family HMM PF00361 GB:PROTEIN_ID ACF69214.1 GB:DB_XREF GI:194408995 GB:GENE:GENE hycC LENGTH 608 SQ:AASEQ MSSLSLITSGVAWFAAAAVLAFLFSFHKALSGWIAGIGGAVGSLCTAGAGFTALTSAVTVSGVMPFTGHMLQITPLNAIWLITLGLCGLFVSLFNIDWHRHPQVKANGLLINLLMAAAVCAVVASNLGTMVVMAEIMALCAVFLTGGSKEGKLWFVLGRLGTLLLAIACWLVWQRYGTLDLGLLDQRAQQLPLGSDIWLLGVIGFGLLAGIIPLHGWVPQAHANASAPAAALFSTVVMKIGLLGILTLSLLGGNAPLWWGVALLVLGMITAFVGGLYALMEHNIQRLLAYHTLENIGIILLGLGAGVTGIALNQPVLIALGLTGGLYHLLNHSLFKSVLFLGAGSIWFRTGHRDIEKLGGIGKRMPVISIAMLVGLMAMAALPPLNGFAGEWVIYQSFFKLGNSGAFVGRLLGPLLAVGLAITGALAVMCMAKVYGVTFLGAPRTKEAENASCAPILMGVSVVALAICCVLGGVAAPWLLPMISTAVPLPLETAHTTVSQPMITLLLVACPLLPFIIMAMFKGNRLPSRSRGAAWVCGYDHEQSMVITAHGFAMPVKEAFAPVLKLRKWLNPVSLVPGWQNAAAAGLFRRLALIELAVLVVIVVSRGA GT:EXON 1|1-608:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->580|HYCC_ECOLI|0.0|88.8|580/608| TM:NTM 16 TM:REGION 4->26| TM:REGION 40->62| TM:REGION 75->96| TM:REGION 105->124| TM:REGION 130->146| TM:REGION 153->175| TM:REGION 194->216| TM:REGION 229->251| TM:REGION 259->281| TM:REGION 299->321| TM:REGION 331->353| TM:REGION 365->387| TM:REGION 414->436| TM:REGION 459->481| TM:REGION 500->522| TM:REGION 591->608| SEG 11->24|vawfaaaavlaflf| SEG 116->124|aaavcavva| SEG 221->231|ahanasapaaa| SEG 241->253|gllgiltlsllgg| SEG 296->312|igiillglgagvtgial| SEG 371->385|amlvglmamaalppl| SEG 582->604|aaaaglfrrlalielavlvvivv| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 263->411|2c1wA|2e-04|7.2|139/273| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 154->367|PF00361|1e-15|34.3|198/268|Oxidored_q1| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 124->395|PF00361|2.8e-39|30.4|260/270|Oxidored_q1| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0008137|"GO:NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0042773|"GO:ATP synthesis coupled electron transport"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0055114|"GO:oxidation reduction"|PF00361|IPR001750| OP:NHOMO 980 OP:NHOMOORG 570 OP:PATTERN --2-1-----------1-------2111122----111-----1-1-2-3623-5336374211--22 122-11-21121--11-11-11--111111111----1111--1---1121--11--1---11-121-1-1--------1--1-111322122------1------32-----------------211313211321--1-3332211232212233333343221233432322---312211-1----2-111111111111-1---3111121112-2332111121111-2222222222222222231-----------------------------------------------------------------------4--2----------2--------2---1--11342---1313--2-1--141----111212-2112222622211111111112-22122221211--1123443124422131--211111----------311-1226--122222------1111111111122221111--1----111111-111111122122121132231---1122211111422111-21----------222312211-313-222112-5343333-C333313-1-3221----------------342411221-2--1--1------21-----111-12---241-------112221-3331311112-333331133331323333311131112111111111111111122132223--4111111111111-111111-1111311------3----------11111-1-11111111-1--1----2---1111111111--------------3312122111-111223---1111------------------------------------121111-11-25- -----------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 139 STR:RPRED 22.9 SQ:SECSTR ######################################################################################################################################################################################################################################################################HHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHTTccccc##########HHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHTTccccccccccccccHHHHHHHHHTTcEEEEEEccccccccTTccEEEEEEEETTcccccEEE##################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-2| PSIPRED cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHccccccccccccccEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccc //