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Streptococcus pneumoniae G54 (spne4)
Gene : igA
DDBJ      :igA          immunoglobulin A1 protease
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  1/68 : Bacteria  25/915 : Eukaryota  20/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.19.1
:1945 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   1160->1276 3gfvB PDBj 2e-04 28.3 %
:RPS:PDB   3->96 3c8gA PDBj 1e-12 19.1 %
:RPS:PDB   1454->1581 2b3wA PDBj 3e-04 11.7 %
:RPS:SCOP  493->617 1bvp12  b.19.1.1 * 7e-05 12.1 %
:RPS:PFM   320->393 PF07501 * G5 9e-09 45.9 %
:RPS:PFM   409->587 PF09770 * PAT1 6e-05 25.9 %
:RPS:PFM   646->875 PF05342 * Peptidase_M26_N 7e-60 58.7 %
:RPS:PFM   1188->1941 PF07580 * Peptidase_M26_C 0.0 52.3 %
:HMM:PFM   1187->1941 PF07580 * Peptidase_M26_C 7.5e-295 51.2 724/737  
:HMM:PFM   615->875 PF05342 * Peptidase_M26_N 1.5e-97 52.0 250/250  
:HMM:PFM   319->393 PF07501 * G5 5.1e-22 44.0 75/79  
:HMM:PFM   6->32 PF04650 * YSIRK_signal 2.5e-12 48.1 27/27  
:HMM:PFM   881->905 PF07581 * Glug 1.1e-05 36.0 25/28  
:HMM:PFM   950->973 PF07581 * Glug 0.0009 29.2 24/28  
:HMM:PFM   89->124 PF00746 * Gram_pos_anchor 3.8e-08 30.6 36/39  
:BLT:SWISS 1->1945 IGA1_STRR6 0.0 64.6 %
:PROS 1588->1597|PS00142|ZINC_PROTEASE
:TM
:REPEAT 7|417->433|434->450|451->484|485->518|522->555|556->589|590->609
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ACF56607.1 GT:GENE igA GT:PRODUCT immunoglobulin A1 protease GT:DATABASE GIB00761CH01 GT:ORG spne4 GB:ACCESSION GIB00761CH01 GB:LOCATION 1018653..1024490 GB:FROM 1018653 GB:TO 1024490 GB:DIRECTION + GB:GENE igA GB:PRODUCT immunoglobulin A1 protease GB:NOTE identified by match to protein family HMM PF00746; match to protein family HMM PF04650; match to protein family HMM PF07501; match to protein family HMM PF07580; match to protein family HMM PF07581; match to protein family HMM TIGR01167; match to protein family HMM TIGR01168 GB:PROTEIN_ID ACF56607.1 GB:DB_XREF GI:194358159 GB:GENE:GENE igA LENGTH 1945 SQ:AASEQ 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DISOP:02AL 1-2,165-748,1409-1417,1812-1819,1944-1946| PSIPRED ccccccccccEEEEEEccEEEEEEEEEHHHHHHHHccHHHHHHHcccccEEEEccccccHHHHHHHHHcccccccccccEEEEEEEcccccHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEEEEcccccEEccccccccccHHHccHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEcccccccccccccccEEEEEccccccccccccccccccEEEccccccccccccccHHHHHHHHHHccccEEEEEcccccccccccccccccccccccccEEccccccEEEEccccccccccccccEEEcccccccccccccccEEEEEEccccEEEEEEEEEEEEEcccccccEEccccccEEEEEEEEEEEEcccccccccccccEEEEEEccccEEEEEEEEEEEEccccccccccccEEEEEcccEEEEEEEEEEEEEcccccccccEEEccccccccccccccEEEEEEEEcEEEcccccEEcccccccEEccEEEcccccEEEEEEEEccccccccccccccEEcccHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHcccccccccEEEEEEEEEEEEccccEEEEHHcccccccEEEEEEccccEEEEEEEEHHHHccEEEEEEccccEEEcHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEcEEEEEcccccccccccHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHcccEEEEEcccccHHHHHHcccccccccEEEEccccccccccccEEEEccccccccEEEEEEcHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHcccccccEEcccccccccEEEEEccccccHHHHHHHccccccEEEccccccccccEEEEEEEEEccccccEEEEEEEEEccccEEEEccccccccccHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHccccccEEEEcccHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEccccccccccHHHHHccccHHHHHHHHHHHHcccccccccccccEEEEEEccHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHccccccccccEEEcccHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEcccccccccccEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHcccc 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