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Thermobifida fusca YX (tfus0)
Gene : AAZ54386.1
DDBJ      :             NADH dehydrogenase (quinone)
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  63/68 : Bacteria  691/915 : Eukaryota  48/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:547 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   222->441 2c1wA PDBj 5e-12 9.2 %
:RPS:PFM   135->405 PF00361 * Oxidored_q1 6e-28 35.5 %
:HMM:PFM   137->404 PF00361 * Oxidored_q1 6.6e-57 33.6 265/270  
:HMM:PFM   71->103 PF00662 * Oxidored_q1_N 8.4e-06 30.3 33/62  
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:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAZ54386.1 GT:GENE AAZ54386.1 GT:PRODUCT NADH dehydrogenase (quinone) GT:DATABASE GIB00263CH01 GT:ORG tfus0 GB:ACCESSION GIB00263CH01 GB:LOCATION complement(389729..391372) GB:FROM 389729 GB:TO 391372 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT NADH dehydrogenase (quinone) GB:PROTEIN_ID AAZ54386.1 GB:DB_XREF GI:71914484 InterPro:IPR003916 InterPro:IPR003918 LENGTH 547 SQ:AASEQ MEALLPYLVPLPVVVPLLAAGLKFAIGVRSPLLNQMISVVALVVVLATGGALLFGVHAYGPQVVQVGGWEFPIGITLVADRLSALMVTVSSAITLGVLVYSIGQGIADQEEATPLAIFYPTFLILVAGVSNAFLTGDLFNLYVGFEILLTSSYVLMTQGGTLARIRAGSTYVVVSLLSSVVFLIAIALIYAATGTVNMAHLALRLAELPTELQLTLQAILLMAFAIKAAVFPLSAWLPDSYPTAPAPVTAVFAGLLTKVGVYAIIRTQTLLFPEDSVVDTLLLWAALATMVIGIFGAMAQTDIKRMLSFILVSHIGYMVFGIGLASVHGMSGAVFYVAHHITVQTTLFLVAGLVERRCGSSSLNNVSGLAKISPVLGVLFFIPAMNLAGIPPLSGFLGKLGLIQAGVQDGSPLAYLLVGGAVATSLLTLYSIVRLWNYAFWRAPEEGRPVALGTLLESSEDESSDLPNGNAVPIPAGRAPTGIGGKAVVTSDVFPPLMLGATVALVLLGVAFTVFAGPLINYSYEAAVELTARTSYLNAVIPGGAAQ GT:EXON 1|1-547:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 60->441|MRPD_BACPF|4e-68|39.2|375/493| TM:NTM 14 TM:REGION 5->27| TM:REGION 36->58| TM:REGION 78->100| TM:REGION 113->135| TM:REGION 141->163| TM:REGION 175->197| TM:REGION 214->236| TM:REGION 246->268| TM:REGION 275->297| TM:REGION 306->328| TM:REGION 333->355| TM:REGION 377->399| TM:REGION 415->437| TM:REGION 494->516| SEG 4->18|llpylvplpvvvpll| SEG 39->56|vvalvvvlatggallfgv| SEG 172->183|vvvsllssvvfl| SEG 242->251|ptapapvtav| SEG 455->466|llessedessdl| SEG 499->516|lgatvalvllgvaftvfa| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 222->441|2c1wA|5e-12|9.2|207/273| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 135->405|PF00361|6e-28|35.5|265/268|Oxidored_q1| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 137->404|PF00361|6.6e-57|33.6|265/270|Oxidored_q1| HM:PFM:REP 71->103|PF00662|8.4e-06|30.3|33/62|Oxidored_q1_N| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0008137|"GO:NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0042773|"GO:ATP synthesis coupled electron transport"|PF00361|IPR001750| GO:PFM GO:0055114|"GO:oxidation reduction"|PF00361|IPR001750| OP:NHOMO 3304 OP:NHOMOORG 802 OP:PATTERN 22425141222222327-1111--55566575111112111113111335736-744A4D54333-33 6673542544422243344-45--454444445575455543352524722-223242--77533756785--------4-166833533333---2--3-332-66643--------------353353553365788996668389888897777444455A867AA7633344443334433422--2-5233333333333333342222233353544222222223324444444444444444444----------------------------------------------------------------------14--3----------2-------131--6--236653--234622311--5A3322544445544335556C88744444444444-553553644262477779B655BB45565766788845433333333744-457A6666666644553455434344444555532322-55555444444433334446545535448557533333335445557555576533332222222558636535-535-555116-87747A85L55554B-6355433333333333233333644666333-4-22-22------53-----333-562--E67723-22233553437774744445-7777744676747577776444533344344444444434344354555573-533333333333333655554333362252----2----------555555533352545555547555555453333333335----11111-----55555555553333334-333333------------------------------------242222-2315B2 ---------------------------21--22222-------21--2------473-----1-1----------------------------2---23------2------21121-----2-3--2-25--22-----2--22--------2-2------11-1221----2-2----------2-6-11------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 207 STR:RPRED 37.8 SQ:SECSTR #############################################################################################################################################################################################################################TTccccTTTEEEcccccccccccccccEEEEHHHHTTTcTHHHHH#########HHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHTTcccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHTTccccccccccccHHHHHHHTTcEEEEEEccccccccccTTccEEEEEEEETTccccc####EEEEccccHHHHHHHHHHHHH########################################################################################################## DISOP:02AL 546-547| PSIPRED ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHcccccc //