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Thermobifida fusca YX (tfus0)
Gene : AAZ54441.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  3/68 : Bacteria  45/915 : Eukaryota  53/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.118.8c.37.1f.1.4
:1523 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   1101->1253 3edtH PDBj 4e-05 22.9 %
:BLT:PDB   1291->1417 3ceqB PDBj 1e-05 33.1 %
:RPS:PDB   701->1048 2a5yC PDBj 1e-09 10.0 %
:RPS:PDB   1143->1410 3ceqB PDBj 5e-23 17.7 %
:RPS:SCOP  697->873 2a5yB3  c.37.1.20 * 7e-10 22.3 %
:RPS:SCOP  1244->1420 1ddbA  f.1.4.1 * 3e-13 8.8 %
:HMM:SCOP  689->890 1w5sA2 c.37.1.20 * 1e-12 25.0 %
:HMM:SCOP  1118->1281 1kt1A1 a.118.8.1 * 6.5e-05 25.8 %
:HMM:SCOP  1211->1421 2c2lA1 a.118.8.1 * 9.5e-10 27.3 %
:HMM:PFM   711->951 PF00931 * NB-ARC 8.9e-16 24.3 230/285  
:BLT:SWISS 708->842 DRL37_ARATH 5e-06 31.8 %
:BLT:SWISS 1123->1224 TIF31_NEUCR 5e-05 28.4 %
:BLT:SWISS 1207->1411 NPHP3_MOUSE 2e-09 22.0 %
:REPEAT 2|1096->1174|1178->1258
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAZ54441.1 GT:GENE AAZ54441.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00263CH01 GT:ORG tfus0 GB:ACCESSION GIB00263CH01 GB:LOCATION 449924..454495 GB:FROM 449924 GB:TO 454495 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT hypothetical protein GB:PROTEIN_ID AAZ54441.1 GB:DB_XREF GI:71914539 LENGTH 1523 SQ:AASEQ 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689->890|1w5sA2|1e-12|25.0|200/0|c.37.1.20|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| HM:SCP:REP 1118->1281|1kt1A1|6.5e-05|25.8|155/168|a.118.8.1|1/2|TPR-like| HM:SCP:REP 1211->1421|2c2lA1|9.5e-10|27.3|187/0|a.118.8.1|2/2|TPR-like| OP:NHOMO 526 OP:NHOMOORG 101 OP:PATTERN --------------------------------------------------121--------------- 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DISOP:02AL 1-19, 52-92, 97-143, 423-436, 670-699, 788-792| PSIPRED cccccccccccccccccHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHccHHHccccccEEEEEEEEccccEEEHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEEcccccccccccccccHHccccccccEEEEEEEccccHHHccHHHHHHHHHHHccccEEEEccccHHHHHcccccccccEEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHccccccccccccEEccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHcccHHHccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccccHHHHHHHcccccccEEEEEEccHHHHHHccccEEEcccccHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHcccccEEEcccc 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