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Thermobifida fusca YX (tfus0)
Gene : AAZ54561.1
DDBJ      :             putative ATP-dependent DNA helicase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  14/68 : Bacteria  868/915 : Eukaryota  52/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1c.52.1
:1044 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   21->448,618->720 1uaaB PDBj 6e-28 28.3 %
:RPS:PDB   8->286,622->720 3e1sA PDBj 1e-26 17.1 %
:RPS:SCOP  20->720 1qhh.1  c.37.1.19 * 9e-43 25.6 %
:RPS:SCOP  801->958 1w36B3  c.52.1.24 * 2e-08 17.8 %
:HMM:SCOP  19->720 1qhh.1 c.37.1.19 * 9.6e-105 33.2 %
:RPS:PFM   25->448 PF00580 * UvrD-helicase 1e-39 35.9 %
:RPS:PFM   802->1041 PF10926 * DUF2800 7e-06 30.3 %
:HMM:PFM   21->480 PF00580 * UvrD-helicase 3.4e-76 28.2 447/533  
:HMM:PFM   801->1039 PF10926 * DUF2800 5.6e-07 20.0 230/372  
:BLT:SWISS 21->720 PCRA_STAES 2e-34 27.8 %
:BLT:SWISS 795->886 ADDB_CLOTH 5e-05 32.1 %
:BLT:SWISS 867->1037 VG69_BPML5 1e-05 29.8 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAZ54561.1 GT:GENE AAZ54561.1 GT:PRODUCT putative ATP-dependent DNA helicase GT:DATABASE GIB00263CH01 GT:ORG tfus0 GB:ACCESSION GIB00263CH01 GB:LOCATION 589304..592438 GB:FROM 589304 GB:TO 592438 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT putative ATP-dependent DNA helicase GB:PROTEIN_ID AAZ54561.1 GB:DB_XREF GI:71914659 LENGTH 1044 SQ:AASEQ 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---------------111111111-11----------------------111111111-1---1--2-------1---------1-1---1-11----1111-1---141------------------------------------------------1---------------1-21181-11--1121-1------1 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 717 STR:RPRED 68.7 SQ:SECSTR 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DISOP:02AL 1-3, 8-21, 609-610, 803-804, 1041-1044| PSIPRED 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