[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Thermobifida fusca YX (tfus0)
Gene : AAZ54747.1
DDBJ      :             bacteriophage (phiC31) resistance gene pglY
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  12/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:1261 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   1028->1157 2h1hB PDBj 2e-04 28.9 %
:RPS:PFM   410->469 PF11944 * DUF3461 8e-04 34.5 %
:HMM:PFM   75->102 PF03969 * AFG1_ATPase 0.00041 28.6 28/362  
:HMM:PFM   377->460 PF04465 * DUF499 0.00017 25.0 76/1036  
:BLT:SWISS 51->137 KIF4_CHICK 7e-04 29.9 %
:BLT:SWISS 1028->1157 RFAC_ECOLI 7e-04 28.9 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAZ54747.1 GT:GENE AAZ54747.1 GT:PRODUCT bacteriophage (phiC31) resistance gene pglY GT:DATABASE GIB00263CH01 GT:ORG tfus0 GB:ACCESSION GIB00263CH01 GB:LOCATION 820662..824447 GB:FROM 820662 GB:TO 824447 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT bacteriophage (phiC31) resistance gene pglY GB:PROTEIN_ID AAZ54747.1 GB:DB_XREF GI:71914845 LENGTH 1261 SQ:AASEQ MTTSHPAASGKRFIGDLIEIPEAIHDGDLVFKVSEGTGGVDEEKQAQAIRDYVVTPQLARNFDEALTTIKGALAKGQSRATYLNGSFGSGKSHFMAVLHAILRHDPVARGLPRMPDILAKHDDWLAGKKFLLVASHLVDAESIEAAILGGYVRTVRRLHPDASVPPVYRADGLLADARELRARLGDEKFIADLPNPRGATASSGWGNTPWAAHSWTSEKLDEAFNVPAGTTDPEQARLRNNLISALLGSHFKRYADVVHGKGEAFVTLDEGLSLISRHAKEELGYDAVVLLLDELILRFTRFLGGDEARINAEAQKMSKLVESSESYRPAPIISFVPRQRDLRDLVGTNVTGATGGLFDTLKYWDGRFGHIKLDDSNLSEVVRHRLLRPKNSEAAAEISAAFERMVNTRPEVRDTLLDSSGGEADTWDDFRALYPFSPALLHVMVDLSAALQRQRSALKLMQQLLIDHRTTLPVGQLVPLGAILDVLVAGEDKPFHDRLSVEYEKIRNFYRDKVRPWLLSRHKLTEETAANLDVRNPFRAEDLLVKTMLLAALVPNVPALKEITVSRMIALNHGIIPARRTGQDIARTAAFFRELSAQFGEVRVGPGDNPTISLNLLRVDTESLMRSSYHAASDQAMRRLFKRLLWEELGLEPDATRTHILWRGTLRTVELDFGNVRSEDSLMRQRFEPEDPAAIRIVIDYPFDEGTHSPAEDRQRVQVLREEFDNPPATLVWLPHFLSESRQQDARRLLMMEYLLQDGVIEEKAPDWSSDDRREAYNQIDNQATQLRERLRGLLRSLYGATEPDDTEVGERVTQHVEAFLPNVDIAIEAGSQLRDALQRLAGKLLDHLYPEHPDFTATSGARREVRRSDLNAVLHAVEKAKADRLQRYEPENKNEIQALRRVAQPLNLATVSEVFVLRDTWLTALDDAARTEYADITDIKVRDLKKWIRERGDGKGLPDDIVDLLVLVYAIQSDRAWIRAGRRYTQVAIGSLEGDIVLRRQPLPSEEDFAIANQRAKLLFGLEPQPVRNARAVQRLAEQLKEKSVDWFAATESLLSQLQRHTEMLELDEEAPRLRTANITYDLLGQIRGQTEDSTLITALARADLPGDAAVYKVSMETAANVAAALDGAHWKFLRTLEKIAKGAGEHAPEARRLLQELRTVARHNEQQKKLATALDQITGEAIALIEKSVDPSTPGGEKKDDFSGPRPVTPPPPPSYTNAETTIRVSPGEDPAAAVANLRSRLNIPEDTELEIIVRVVRR GT:EXON 1|1-1261:0| BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 51->137|KIF4_CHICK|7e-04|29.9|87/100| BL:SWS:REP 1028->1157|RFAC_ECOLI|7e-04|28.9|128/319| SEG 169->186|radglladarelrarlgd| SEG 392->401|seaaaeisaa| SEG 549->560|llaalvpnvpal| SEG 787->798|lrerlrgllrsl| SEG 960->969|ddivdllvlv| SEG 1207->1216|prpvtppppp| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 1028->1157|2h1hB|2e-04|28.9|128/315| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 410->469|PF11944|8e-04|34.5|55/125|DUF3461| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 75->102|PF03969|0.00041|28.6|28/362|AFG1_ATPase| HM:PFM:REP 377->460|PF04465|0.00017|25.0|76/1036|DUF499| OP:NHOMO 12 OP:NHOMOORG 12 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ---------------------1--------------------1----------------------11-111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1------1------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 128 STR:RPRED 10.2 SQ:SECSTR ###################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHTTTTccccEE#EEcTTTcccGGGGGGccEEEcccccccHHH#HHHHHHHHHHTccccccccccccTHHHHTTccTTTTcEEEEEcccccGGGcccHHHHHHHHHHEEEccccHHHHHHHHHHHT######################################################################################################## DISOP:02AL 1-9, 1192-1204| PSIPRED ccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHcccHHHcccccccHHHHHHHHHHcccEEEEHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHcccccEEEEccccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHccccccHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEccccccEEEEEEEcccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEEccEEEEEEEcccccHHHHHHccccccccccEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEcccEEcHHHHHHHcccHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHccccccccccccccccccccEEEEcccccHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEEEEcc //