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Thermobifida fusca YX (tfus0)
Gene : AAZ54756.1
DDBJ      :             conserved hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  23/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.7.12
:578 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   220->344 2efrB PDBj 1e-04 20.4 %
:RPS:PDB   224->363 3cwgA PDBj 3e-04 12.3 %
:RPS:SCOP  234->337 1t72A  a.7.12.1 * 1e-05 21.0 %
:RPS:PFM   174->227 PF04276 * DUF443 3e-04 31.5 %
:RPS:PFM   224->365 PF09726 * Macoilin 2e-06 26.9 %
:RPS:PFM   481->577 PF10088 * DUF2326 2e-17 45.3 %
:HMM:PFM   442->578 PF10088 * DUF2326 2.9e-40 36.6 134/140  
:HMM:PFM   223->299 PF07106 * TBPIP 2.8e-05 25.7 70/169  
:HMM:PFM   333->421 PF07106 * TBPIP 0.00097 24.1 87/169  
:BLT:SWISS 20->379 YYDD_BACSU 3e-16 20.5 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAZ54756.1 GT:GENE AAZ54756.1 GT:PRODUCT conserved hypothetical protein GT:DATABASE GIB00263CH01 GT:ORG tfus0 GB:ACCESSION GIB00263CH01 GB:LOCATION 837198..838934 GB:FROM 837198 GB:TO 838934 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT conserved hypothetical protein GB:PROTEIN_ID AAZ54756.1 GB:DB_XREF GI:71914854 LENGTH 578 SQ:AASEQ MLRELGSDDPRFRTVRFRPGLNLIVADRTATSTPDQSRNAVGKTSVVELLHFLLGADKTGIKLMDDKTISQATFRLDMDWPGQEDPIRIRRSGRSPNEILLNPDITQESHTLFEDEKPVTLKEWRAAIERDLFGIRPEDKGLSGRILLNLYMRREEKGGFKDALKPAERTSAHLVTTNLSYLLGMDWRLARRYVDLSEREATRRKLVAAQKDPVWGKIVGSSAELRGQIRTVQQRVNELEQQINEFKVVPEYEEIQREADEVNRRIRKLRNEEAVHRRNLEELEQAVTDVYEPDDRYLERAYAELNVILGDQVRARFDQVREFHQAVVRNRRHYLQEEITQLRERIRASEQEREELGRRQAELMRILNEGGALDTLTVLQNALGQERARLEALQHRLAAAQALEQSKREIDREKDRLEEEMQIDIEERAEVEQQAHALFSSFVQELYGNDRTPYLAFKARKSSLDIILQLDSDSSSGISNMKTFCFDLTCAIIAHREGRGPDFLVHDSKLYDGVDERQVYRALTLAARLMEDEGMQYVVTINSDDLAKAENLGFDPDPYVIKPRLNDTPSGGLFGFRF GT:EXON 1|1-578:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 20->379|YYDD_BACSU|3e-16|20.5|347/586| COIL:NAA 145 COIL:NSEG 4 COIL:REGION 217->249| COIL:REGION 253->287| COIL:REGION 335->369| COIL:REGION 385->426| SEG 386->405|erarlealqhrlaaaqaleq| SEG 462->479|ssldiilqldsdsssgis| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 220->344|2efrB|1e-04|20.4|113/154| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 224->363|3cwgA|3e-04|12.3|130/501| RP:PFM:NREP 3 RP:PFM:REP 174->227|PF04276|3e-04|31.5|54/197|DUF443| RP:PFM:REP 224->365|PF09726|2e-06|26.9|134/432|Macoilin| RP:PFM:REP 481->577|PF10088|2e-17|45.3|95/137|DUF2326| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 442->578|PF10088|2.9e-40|36.6|134/140|DUF2326| HM:PFM:REP 223->299|PF07106|2.8e-05|25.7|70/169|TBPIP| HM:PFM:REP 333->421|PF07106|0.00097|24.1|87/169|TBPIP| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0016021|"GO:integral to membrane"|PF09726|IPR019130| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 234->337|1t72A|1e-05|21.0|100/215|a.7.12.1| OP:NHOMO 23 OP:NHOMOORG 23 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------1---1-------1---------1-------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1-11---------------------1---------------------------------1----------------------------------------1------------------------------------1--1---------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------1----------1111----------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 150 STR:RPRED 26.0 SQ:SECSTR ###########################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccccccTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTTcccTTcTGHHHHHH################################################################################################################################################################################################################# DISOP:02AL 6-7, 30-41, 467-480| PSIPRED cccccccccccEEEEcccccEEEEEEcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHccEEEEEEEEEcccccEEEEEEEccccccEEEccccccccccEEcccccccHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEccccEEEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEccHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEcHHHccHHHccccccccEEEEEEccccccccEEEEcc //