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Thermobifida fusca YX (tfus0)
Gene : AAZ56156.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  11/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.118.8
:751 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   154->217 2axzB PDBj 1e-05 4.7 %
:RPS:SCOP  153->250 1w3bA  a.118.8.1 * 4e-06 24.7 %
:HMM:SCOP  111->249 1kt1A1 a.118.8.1 * 8.7e-09 23.1 %
:HMM:PFM   111->137 PF07719 * TPR_2 2.6e-05 40.7 27/34  
:BLT:SWISS 177->252 HTPG_HALHL 4e-04 36.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAZ56156.1 GT:GENE AAZ56156.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00263CH01 GT:ORG tfus0 GB:ACCESSION GIB00263CH01 GB:LOCATION 2481774..2484029 GB:FROM 2481774 GB:TO 2484029 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT hypothetical protein GB:PROTEIN_ID AAZ56156.1 GB:DB_XREF GI:71916254 LENGTH 751 SQ:AASEQ MADPHRLMSRLPVSLVARDPAAALRRAQRLLGSSTDPRIRSLALRISGLAVYELGSFTEARKRLTEAVRVAVQANLAEEALLARASWTGALSRYPGPSPRIPVATASTSSALWLLAQGVAAYHSGRFDDALAAFTAAEPALRTASDPRLLPGLLCSRGLALIRAGRLTEAEETLLHGLALAEQYSLPRLSAMITQNLGCLAARQGDTGLAMARFAQAAPLLQTPTRYPALVLERAHALADAGMVREAWQLNLSLGKIRGCGADRALAELLSLKIAVASRAHVKVAATVDLLERLFGAESAWLRAAEQITETWGGSLPAPRAVPPPPATPHLEVAAHATPLRTAQALHHATAALQSGAAKAALRRLEQARTIDLGPHTCRNQRWAALLDRYRATFAEAWRGVSTARYKLHELEVEMAVDQWHPCCRPRDASSGQGWEDPWEALSTGLGSRALVHYSDLDQAPAALTVVDGTVRLHELAAGSTIKDAVTHFEHLAAQHVFSPGPTTARLLARRAEEVQRLLFEPIAAAIGDREMVIAPGAYTQVLPWGLLPALRGRPISVVPSGQVWLRCRQRALHSRQPPRALLVAGPGPEDAEAEVRAIARLYPRSRILVGAKARSRTVLRGLARADLAHFSAHGFARNGAPMCAGLVLADGPLLAYDVERVQHLPALVVLSSCTTGRPMPAVPSGFPLGIAASLLARGSATVVASVLRVPDVQAAAAMVRAHQALRSGVPPATVVAEHLAHLGFVCFGAG GT:EXON 1|1-751:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 177->252|HTPG_HALHL|4e-04|36.0|75/100| SEG 15->31|lvardpaaalrraqrll| SEG 70->85|vavqanlaeeallara| SEG 126->144|rfddalaaftaaepalrta| SEG 317->329|papravppppatp| SEG 342->361|taqalhhataalqsgaakaa| SEG 713->725|vqaaaamvrahqa| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 154->217|2axzB|1e-05|4.7|64/299| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 111->137|PF07719|2.6e-05|40.7|27/34|TPR_2| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 153->250|1w3bA|4e-06|24.7|89/388|a.118.8.1| HM:SCP:REP 111->249|1kt1A1|8.7e-09|23.1|130/168|a.118.8.1|1/1|TPR-like| OP:NHOMO 13 OP:NHOMOORG 11 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --2-1-----------------------------------1-------------------111-2-1-1-1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 163 STR:RPRED 21.7 SQ:SECSTR #####################################################################################################################################################HHHHHHHHHHHHHHHTccHHHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHHHHTTccccccccccEcccHHHHHccHHHHTTccEEEEEEETTTTEEEEEEHHHHHHTGGGcccHHHHHHHHHHHHHHH#HHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcc###################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-5, 568-582| PSIPRED cccHHHHHHHccHHHccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHccEEEEHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHccHHHHccccccHHHHHHHHccHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHcccccEEEcccccHHHHHHHHHHccHHccccccHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHcccHHcccHHEEEcccccEEEEEEEcccEEEEEEEEcccEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccHHHHHHHHHHccccccEEEEHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHccccEEccccccHHHHHHHcccccEEEEEEcEEccccccccccEEcccccccHHHHHcccccccEEEEEccccccccccccccHHHHHHHHHHHccHHHHEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccc //