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Thermobifida fusca YX (tfus0)
Gene : AAZ57021.1
DDBJ      :             drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  39/68 : Bacteria  655/915 : Eukaryota  101/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.38.1
:514 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   40->177 2gfpA PDBj 3e-06 27.5 %
:RPS:PDB   71->184 2d33D PDBj 3e-05 9.6 %
:RPS:SCOP  4->183 1pw4A  f.38.1.1 * 6e-13 13.9 %
:HMM:SCOP  1->512 1pw4A_ f.38.1.1 * 5.2e-79 34.7 %
:RPS:PFM   39->182 PF07690 * MFS_1 2e-14 34.0 %
:HMM:PFM   29->422 PF07690 * MFS_1 1.1e-56 31.3 342/353  
:BLT:SWISS 41->442 YUSP_BACSU 2e-50 33.5 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAZ57021.1 GT:GENE AAZ57021.1 GT:PRODUCT drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily GT:DATABASE GIB00263CH01 GT:ORG tfus0 GB:ACCESSION GIB00263CH01 GB:LOCATION 3499590..3501134 GB:FROM 3499590 GB:TO 3501134 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily GB:PROTEIN_ID AAZ57021.1 GB:DB_XREF GI:71917119 InterPro:IPR001411 InterPro:IPR001958 InterPro:IPR004638 InterPro:IPR007114 LENGTH 514 SQ:AASEQ MTVPARSDSSETSPAPITRRSVVLIFLALMLAMLLASLNQTVLSTALPTMVGELNGVDQMLWVMTAFILASTIMMPIYGKLGDLIGRKGLFLAAISLFIAGSVIGGLAPTMDWLIAGRVVQGLGGGGLMIMSQAIIADIVPARQRGRYAGFIGAVFAVSSVAGPLLGGWFTEGIGWRWAFWINIPLGLLALAAAAFLLRLPRPRPERLHVDAWGMAFLAAATTCLILTSTWGGSQYTWNSPVIIGLILGTVVSSALFILAEHRAAEPIIPLHLFRDRTFVLTTVAGLLTGLMMFGILGYVPTYVQMATGTEATVAGLLMTPMMGGLLVTSIGTGQFVSRTGRYKWIPVGGSLIVTAGLLLLSTVTPTTPIWAICGYLVVVGIGLGSSMQLLVLMVQNAFPLSQVGTATAANNFFRQIGASLGSAIVGSLFTVRLMDFLTERLPGGAALPSGGTTSSLTPELVHRLPDSLRQVVIDSYNDALIPLFLVLSPLGLVAAALLTLVKEKPLATTIERD GT:EXON 1|1-514:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 41->442|YUSP_BACSU|2e-50|33.5|400/541| TM:NTM 13 TM:REGION 22->44| TM:REGION 59->81| TM:REGION 89->111| TM:REGION 117->139| TM:REGION 148->170| TM:REGION 178->199| TM:REGION 211->230| TM:REGION 239->261| TM:REGION 277->299| TM:REGION 314->336| TM:REGION 345->367| TM:REGION 373->395| TM:REGION 480->502| SEG 27->38|lalmlamllasl| SEG 122->128|glggggl| SEG 185->208|plgllalaaaafllrlprprperl| SEG 278->291|tfvlttvaglltgl| SEG 316->327|gllmtpmmggll| SEG 358->369|llllstvtpttp| SEG 491->502|lglvaaalltlv| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 40->177|2gfpA|3e-06|27.5|138/375| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 71->184|2d33D|3e-05|9.6|114/499| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 39->182|PF07690|2e-14|34.0|144/347|MFS_1| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 29->422|PF07690|1.1e-56|31.3|342/353|MFS_1| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF07690|IPR011701| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 4->183|1pw4A|6e-13|13.9|180/434|f.38.1.1| HM:SCP:REP 1->512|1pw4A_|5.2e-79|34.7|415/447|f.38.1.1|1/1|MFS general substrate transporter| OP:NHOMO 4619 OP:NHOMOORG 795 OP:PATTERN ------6343334451-3111--2--------1121--1111-874231-341----11-14541--- 3254Y435666444635AA-A722G8999997A778BEJE5E8B98733751A79415--A95367BFKH13111433-24-4131122211-2-------31--7-2-2--------------111111-1111-5775521153--------------------1--3-------------3561---272A889899AB5AC999A61A86A99933445526455559H333333333333333533345572CD35525AA66A9538748322222-1-1122-----------1111111111111------1--1---6A111212111134991332-----2--2-453331-133211-1--11172231111133A884135633412442344448-4433484839--B7749B4DCA46551112212323-112222222231123224------------11---111-1111-----145325432AIIKLLJEBABAGGIJCCBC7DOJK8DAE--56B22433834271241---1431122222---212-1412-2-131224-2-2211421552531121-----------1---------11-55544-22-122212222112333-1111-111-1----------56662545555566655-55555565555645555549FB9A3555425445444445454A55354542-533333333333---15535311112-424----2--11------33333111121-33438977256631565-3323333312332333334112232323222331--------------------------------------------------1--------12- ----11-------16KKaFUSYUonpYJIHIHIeWOEKHIDJKCCBULHZVUmWBIRPNEFH466268552283C2655736676895-JJ8K4G9F9CCA39BAC--1-------------------------------------------------1----1-----------------------11V----1---- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 145 STR:RPRED 28.2 SQ:SECSTR #######################################HHHHHHHHHHHHTTcccTTHHHHHHHHHHHHTTcccGGGcTTcccccTTccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHTTccEETTEEccccccccccGGGccccEEEEccccTTccHHHHHHHHcccEEEEEEEccTTcTTcccHHH########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 1-20, 449-461, 507-514| PSIPRED cccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHcccc //