Thermotoga maritima MSB8 (tmar0)
Gene : AAD35177.1
DDBJ : flagellar hook-associated protein 1
Swiss-Prot:
Homologs Archaea 0/68 : Bacteria 397/915 : Eukaryota 0/199 : Viruses 0/175 --->[See Alignment]
a.47.2
c.1.8
e.32.1
:858 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB 133->323 2d4yB PDBj 1e-05 21.2 %
:BLT:PDB 398->480 2k5vA PDBj 6e-05 33.8 %
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:HMM:PFM 121->196 PF08393 * DHC_N2 0.00038 14.9 74/408
:BLT:SWISS 5->290,550->858 FLGK_BORBU 2e-31 26.6 %
:COIL
:SEG
SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAD35177.1
GT:GENE AAD35177.1
GT:PRODUCT flagellar hook-associated protein 1
GT:DATABASE GIB00025CH01
GT:ORG tmar0
GB:ACCESSION GIB00025CH01
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GB:FROM 85694
GB:TO 88270
GB:DIRECTION -
GB:PRODUCT flagellar hook-associated protein 1
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GB:PROTEIN_ID AAD35177.1
GB:DB_XREF GI:4980572
LENGTH 858
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GT:EXON 1|1-858:0|
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COIL:NAA 33
COIL:NSEG 1
COIL:REGION 793->825|
SEG 208->220|dllderdrildel|
BL:PDB:NREP 2
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RP:PDB:NREP 2
RP:PDB:REP 80->325|2d4yA|2e-12|18.8|245/429|
RP:PDB:REP 744->856|3e66A|2e-11|6.6|106/255|
RP:PFM:NREP 3
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HM:PFM:NREP 4
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GO:PFM:NREP 5
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GO:PFM GO:0009288|"GO:bacterial-type flagellum"|PF00460|IPR001444|
GO:PFM GO:0019861|"GO:flagellum"|PF06429|IPR010930|
RP:SCP:NREP 2
RP:SCP:REP 70->192|1dn1B|8e-05|14.4|104/222|a.47.2.1|
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HM:SCP:REP 180->857|1ucuA_|6.2e-14|17.5|361/0|e.32.1.1|1/1|Phase 1 flagellin|
OP:NHOMO 420
OP:NHOMOORG 397
OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- -11-------------------------------------1---1---1----1--------1-1------------------11111---------------------------------------------------------1---------------------------------------------111111111111111111111111111111111111111111------------------------------------------------------------------------------------------11111111111111121111---212--12111111111111111111--1111111-------1---1-1211-------------11-11111--1----1----------11----1-11-----------1----1-1-----------------------------------11111111111-11111111111111-111111--211111111--1111111111-1-------111-11111-11111121121111111111------1-1111-1111111111111111111----2-11111-111211111211121-2222----1111------21-11111111111111-1111111111111111111---1111111--------------111----11-111111111211---------1111--111-------------------------1111111111211-111-1---------1111211111221111111111112------111111111111111111--------------------------1-11111111-1- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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STR:RPRED 50.3
SQ:SECSTR ###############################################################################cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcTcTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEETTTEEEEEETTccEEEETTEEccEEEEEccccTTcEEEEEEETTTEEEEccGGGccHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcccTTccc########################################################################EEEEEEEEEEEEEEEEEEcTTccEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEGGGGGccccTTcEEEEEEEE###EEETTEEEEEEEEEEE#######################################################################################################################################################################################################################################################################GGGccccEEEEEcTTccEEEEEEcTTccEEEE#######EEcEEEEEEcTTTcEEEEEEEcGGGTTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccGGGcccEEEEccGGGHHHHHHH##
DISOP:02AL 1-3, 52-62, 795-805|
PSIPRED ccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEEEEEcccccccccccccccccccccEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEccccEEEEEEccEEEEEcccEEEEEEEEccccccEEEEEEEccEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEccccccccccccccccccccccEEcccEEEEEEccEEEEEEcccccEEccccccEEEEEEEEEccccccccEEEEEEccHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHccccEEcccccccccccccEEEEEEEEcccccHHHHHHHHHHcccccHHccEEcccHHHHHHHcccccccccccEEEccHHHccccccEEEEEccccEEEEcccEEEEEEEEEEccccccccHHHHcccccEEEEEEEcccccEEcccccHHHHHHHHHHccccccEEcccccccHHEEccccHHHHHHHHHcccccEEEEEccccccccccEEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcc
//
[GTOP]
