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Thermotoga maritima MSB8 (tmar0)
Gene : AAD35177.1
DDBJ      :             flagellar hook-associated protein 1
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  397/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.47.2c.1.8e.32.1
:858 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   133->323 2d4yB PDBj 1e-05 21.2 %
:BLT:PDB   398->480 2k5vA PDBj 6e-05 33.8 %
:RPS:PDB   80->325 2d4yA PDBj 2e-12 18.8 %
:RPS:PDB   744->856 3e66A PDBj 2e-11 6.6 %
:RPS:SCOP  70->192 1dn1B  a.47.2.1 * 8e-05 14.4 %
:RPS:SCOP  576->811 1ktbA2  c.1.8.1 * 2e-04 9.1 %
:HMM:SCOP  180->857 1ucuA_ e.32.1.1 * 6.2e-14 17.5 %
:RPS:PFM   10->39 PF00460 * Flg_bb_rod 2e-04 46.7 %
:RPS:PFM   72->191 PF03962 * Mnd1 3e-04 24.8 %
:RPS:PFM   820->856 PF06429 * DUF1078 8e-07 56.8 %
:HMM:PFM   819->856 PF06429 * DUF1078 2.5e-17 50.0 38/39  
:HMM:PFM   592->637 PF07196 * Flagellin_IN 2.7e-07 37.0 46/56  
:HMM:PFM   10->39 PF00460 * Flg_bb_rod 6.6e-08 43.3 30/31  
:HMM:PFM   121->196 PF08393 * DHC_N2 0.00038 14.9 74/408  
:BLT:SWISS 5->290,550->858 FLGK_BORBU 2e-31 26.6 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAD35177.1 GT:GENE AAD35177.1 GT:PRODUCT flagellar hook-associated protein 1 GT:DATABASE GIB00025CH01 GT:ORG tmar0 GB:ACCESSION GIB00025CH01 GB:LOCATION complement(85694..88270) GB:FROM 85694 GB:TO 88270 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT flagellar hook-associated protein 1 GB:NOTE similar to SP:P70859 PID:1518046 GB:AE000783 percent identity: 49.92; identified by sequence similarity; putative GB:PROTEIN_ID AAD35177.1 GB:DB_XREF GI:4980572 LENGTH 858 SQ:AASEQ 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------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 432 STR:RPRED 50.3 SQ:SECSTR ###############################################################################cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcTcTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEETTTEEEEEETTccEEEETTEEccEEEEEccccTTcEEEEEEETTTEEEEccGGGccHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcccTTccc########################################################################EEEEEEEEEEEEEEEEEEcTTccEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEGGGGGccccTTcEEEEEEEE###EEETTEEEEEEEEEEE#######################################################################################################################################################################################################################################################################GGGccccEEEEEcTTccEEEEEEcTTccEEEE#######EEcEEEEEEcTTTcEEEEEEEcGGGTTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccGGGcccEEEEccGGGHHHHHHH## DISOP:02AL 1-3, 52-62, 795-805| PSIPRED ccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEEEEEcccccccccccccccccccccEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEccccEEEEEEccEEEEEcccEEEEEEEEccccccEEEEEEEccEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEccccccccccccccccccccccEEcccEEEEEEccEEEEEEcccccEEccccccEEEEEEEEEccccccccEEEEEEccHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHccccEEcccccccccccccEEEEEEEEcccccHHHHHHHHHHcccccHHccEEcccHHHHHHHcccccccccccEEEccHHHccccccEEEEEccccEEEEcccEEEEEEEEEEccccccccHHHHcccccEEEEEEEcccccEEcccccHHHHHHHHHHccccccEEcccccccHHEEccccHHHHHHHHHcccccEEEEEccccccccccEEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcc //