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Thermotoga maritima MSB8 (tmar0)
Gene : AAD35622.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  11/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.114.1c.37.1
:758 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   1->43 1us8A PDBj 3e-04 39.5 %
:RPS:PDB   1->47 1e69A PDBj 1e-06 25.5 %
:RPS:PDB   421->619 1dg3A PDBj 2e-04 20.2 %
:RPS:SCOP  1->49 1ii8.1  c.37.1.12 * 3e-10 36.7 %
:RPS:SCOP  405->494 1dg3A1  a.114.1.1 * 2e-04 20.9 %
:HMM:SCOP  1->750 1xew.1 c.37.1.12 * 7.4e-16 21.4 %
:RPS:PFM   399->638 PF12128 * DUF3584 1e-05 27.1 %
:HMM:PFM   3->48 PF02463 * SMC_N 6.5e-06 23.9 46/220  
:HMM:PFM   538->589 PF12325 * TMF_TATA_bd 1.6e-05 38.0 50/121  
:HMM:PFM   291->388 PF04888 * SseC 0.00055 21.0 81/306  
:HMM:PFM   133->193 PF10158 * LOH1CR12 0.00052 26.2 61/131  
:BLT:SWISS 1->46 RECF_PROVI 6e-06 37.0 %
:BLT:SWISS 96->149 IOC3_YEAST 7e-04 38.9 %
:BLT:SWISS 441->748 CN045_HUMAN 3e-08 22.4 %
:TM
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAD35622.1 GT:GENE AAD35622.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00025CH01 GT:ORG tmar0 GB:ACCESSION GIB00025CH01 GB:LOCATION 561471..563747 GB:FROM 561471 GB:TO 563747 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT hypothetical protein GB:NOTE identified by sequence similarity; putative GB:PROTEIN_ID AAD35622.1 GB:DB_XREF GI:4981051 LENGTH 758 SQ:AASEQ MKIERVHVEGFGKFENFSFPLKSGLNIIFGGNAAGKTTLANFIRYCLTGELPELENYRPWFSNRFGGYLETSEGRVEFGQGRLDPELFSFTSFISEGVDNTLNGSKKVASFLMESYRNRPEAVELERILNEDFSVLMKKTKELEAEISNLKERVEAWKEKRRSLLLVLKRKKELSRDLQEKRRLLEEEIDRFESEKSERLSSIEARINEVKAELLRVEKELEEIERETAVPEEKVREAIELAQKLDYLRERGEELKREIESLEEKSKDTEERLKTIMKDFSVSSLEELKLKLENMKLQIELVENEQKAKLNEIIGHLREPLREIDEKLEEIQAKIENTGDHMKRFDKTLSIFRVFVAVFLTFALVSIIFAFLKPGYLFFYLTLAGTGASVISMWNYYRLRKKLFELESEFMNLSTQKRSLIERKNQIVSKLKETAGVDNIEELEKFLRDQIVKKVFERIPFLSKYGSEPRKAVENVEEQMRELLILKSSVEASLSDKKKNLEELQEYSREQEEVLKNTLKEIGVDSEDKLKVLRDLLERRANLRKTRDSLEKEIANLMKEKEEIESSRSNARIEELKREVEQIESELEKLVVSPLEEPFDVLEALFRKKVELEILERAIGYIPEFKDRIKKEHEELLRGYTRDLAVELTDVYRRFFKENQVFKVSPDLMVTINVPEEKKVVDVLNTSALKLLSFQMKRFISRVLEIESPFVVDNTFVDLDDEKIDLLWQELKEVSKTRQVVLFTSDRRLLKEEPVLKL GT:EXON 1|1-758:0| BL:SWS:NREP 3 BL:SWS:REP 1->46|RECF_PROVI|6e-06|37.0|46/371| BL:SWS:REP 96->149|IOC3_YEAST|7e-04|38.9|54/787| BL:SWS:REP 441->748|CN045_HUMAN|3e-08|22.4|290/529| COIL:NAA 247 COIL:NSEG 4 COIL:REGION 129->230| COIL:REGION 236->281| COIL:REGION 476->506| COIL:REGION 526->593| TM:NTM 2 TM:REGION 347->369| TM:REGION 375->397| SEG 158->176|kekrrslllvlkrkkelsr| SEG 209->227|evkaellrvekeleeiere| SEG 253->267|eelkreiesleeksk| SEG 285->297|leelklklenmkl| SEG 352->365|frvfvavfltfalv| SEG 501->513|leelqeysreqee| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 1->43|1us8A|3e-04|39.5|43/129| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 1->47|1e69A|1e-06|25.5|47/263| RP:PDB:REP 421->619|1dg3A|2e-04|20.2|173/540| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 399->638|PF12128|1e-05|27.1|236/1179|DUF3584| HM:PFM:NREP 4 HM:PFM:REP 3->48|PF02463|6.5e-06|23.9|46/220|SMC_N| HM:PFM:REP 538->589|PF12325|1.6e-05|38.0|50/121|TMF_TATA_bd| HM:PFM:REP 291->388|PF04888|0.00055|21.0|81/306|SseC| HM:PFM:REP 133->193|PF10158|0.00052|26.2|61/131|LOH1CR12| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 1->49|1ii8.1|3e-10|36.7|49/369|c.37.1.12| RP:SCP:REP 405->494|1dg3A1|2e-04|20.9|86/300|a.114.1.1| HM:SCP:REP 1->750|1xew.1|7.4e-16|21.4|234/0|c.37.1.12|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 11 OP:NHOMOORG 11 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1111111--- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 220 STR:RPRED 29.0 SQ:SECSTR cEEEEEEEEccTTccccEEEEcccEEEEEccTTTccTHHHHHHHHTc#####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHHHHHHHHHHH#HHHTTTccTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccc#cTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH##################HcTTccH####HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHH##HHHHHHH########################################################################################################################################### DISOP:02AL 156-167, 206-207, 213-214, 311-314, 417-430, 461-512, 535-579| PSIPRED cccEEEEEcccccccccEEEcccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccEEcccccccEEEEEEEccccEEEEEEEHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEcccEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEcccEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHcEEEEEEcccHHHHccccccc //