[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Thermotoga maritima MSB8 (tmar0)
Gene : AAD35703.1
DDBJ      :             conserved hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  13/68 : Bacteria  155/915 : Eukaryota  10/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1c.52.1d.92.1
:1289 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   888->1144 2wjvB PDBj 1e-08 31.9 %
:RPS:PDB   262->341 3cmtD PDBj 3e-05 26.6 %
:RPS:PDB   474->633 3e5bB PDBj 7e-05 9.6 %
:RPS:PDB   835->1013 3cazB PDBj 1e-14 8.6 %
:RPS:PDB   997->1155 3dmnA PDBj 7e-06 15.1 %
:RPS:SCOP  260->315 2bhrA2  c.37.1.14 * 3e-06 17.9 %
:RPS:SCOP  757->1108 1t3aA  d.92.1.7 * 3e-19 9.9 %
:RPS:SCOP  1243->1288 1cw0A  c.52.1.15 * 4e-06 19.6 %
:HMM:SCOP  138->333 1z3iX2 c.37.1.19 * 1.2e-05 17.6 %
:HMM:SCOP  252->1289 1qhh.1 c.37.1.19 * 2.2e-39 23.7 %
:RPS:PFM   250->318 PF01695 * IstB 2e-06 37.7 %
:RPS:PFM   889->924 PF01443 * Viral_helicase1 2e-04 55.9 %
:HMM:PFM   877->927 PF01443 * Viral_helicase1 0.00066 32.0 50/226  
:HMM:PFM   259->303 PF01695 * IstB 1.2e-07 35.6 45/178  
:HMM:PFM   1234->1288 PF04480 * DUF559 9.7e-05 30.8 52/109  
:BLT:SWISS 267->313,888->1177 Y140_MYCGE 3e-32 37.8 %
:BLT:SWISS 385->559 SYK_MYCPE 6e-04 27.5 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAD35703.1 GT:GENE AAD35703.1 GT:PRODUCT conserved hypothetical protein GT:DATABASE GIB00025CH01 GT:ORG tmar0 GB:ACCESSION GIB00025CH01 GB:LOCATION complement(648075..651944) GB:FROM 648075 GB:TO 651944 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT conserved hypothetical protein GB:NOTE similar to GB:AE000666 percent identity: 56.48; identified by sequence similarity; putative GB:PROTEIN_ID AAD35703.1 GB:DB_XREF GI:4981139 LENGTH 1289 SQ:AASEQ MSLSNPLLAVDRARVSKLLIKDSEMTDLFDLLVKRGLKLPVFKYDLTTDRYILEKPGEINFEGTEEEIVRKISRLYSLSKLSIEEKGVVTLFMTFGVLKWNDPGFKTPYLSAPVVMVPCEFEKNKHTNQVSRINFFGEGIQFNPVLELLFREKYDLPLPQIEEIDSKNFNEIIEHLGNLKTQFTIWKVIPQCWIISLNPEMFVLYSDLGKMMQNTEALTHPLINAFSGVLSLSKSSTESVSSVPLVPILRADSSQRKILEMVREGENVVIHGPPGTGKSQTIANIIADAVAREKTVLFVSAKKAALDVVYNRLKNAGLGRFCLEIHSTRKSKQELMFDLKRTIDLLQNFQDVEQPADLLKQFEHLKNNLNNLLNSLHRTDHPLGMSIYDAISRLEGLKDYPVIHSLHLSSIAEISKERFEKILQLMEKLEQLADVYNESQHPWKGFKFSENILSYPLKVIEMLEYVKMNLKNMKQMLEKAGFTDIGNLRFEDFQKILYLLKSLKNVDVLPGRWFQVEIEELSTLREIVEILRKRKVLMKKYFQHTEKSIEEMTEILQPVERFSRSWLRILNPSYWKWKKFVNRNLRYPHNFEEIQRLYEISKNLIDTEIKYNDLKEKIPDQEFSFDEYRTKELEEIDFALIKLDIALKIRKKLPIKIIKNDLILTRVSKDLISRAIEILEDTQLKKYMEDLNRLWPDGFVGEKTLQTAPVDELIRKIDHLIANESKLHEWIQLQETLESLEKMELKTFIRSVEKEHVKNIRRIFEKSFYKQWIDNVCTLDKNLRDFSSERYEQDILTLEKAEEALRKRWVQYVKSLLAKKFRTILADTNHSQQIRILMRETQKKRRHKPIRKFLLEISDILRFVKPCILMSPLSVSSFLDLDKFINYFDIVIFDEASQLRTPEAISAVVRGKQIIVAGDPKQLPPTNFFKSYYELEDDEDEREPLDSFLDECIALPRVFKQGYLRWHYRSRDERLIAFSNHYFYGENPLITFPSPKYRNSDQGIKLVYVENGTWDRAGKRVNTMEALKVVDIVIEHFQKHPDRSIGVVTMNTSQSDLIENLLQRRLMEYPHLMDVIFKESNEPFFIKSLENVQGDERDTIIISIGYARTPSGELFYNFGPLNNEGGWRRLNVLITRARYQIILVTSLRSEDLSRANSENKGVAALRNYLKYAEQNCKLEFCRSYGESDDIIPTSIARQLNNIGFLTDTNIGMGLCQVSVGIEDPEDPGRYKIGIIHDGKNHAMIQDVIDREVLKFKVLESLGWKLKRLWTIEWYRDPEKVLKNIIEHLK GT:EXON 1|1-1289:0| BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 267->313,888->1177|Y140_MYCGE|3e-32|37.8|322/1113| BL:SWS:REP 385->559|SYK_MYCPE|6e-04|27.5|153/489| SEG 227->246|sgvlslsksstesvssvplv| SEG 365->376|lknnlnnllnsl| SEG 645->659|ialkirkklpikiik| SEG 934->946|eleddederepld| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 888->1144|2wjvB|1e-08|31.9|229/768| RP:PDB:NREP 4 RP:PDB:REP 262->341|3cmtD|3e-05|26.6|79/1609| RP:PDB:REP 474->633|3e5bB|7e-05|9.6|156/396| RP:PDB:REP 835->1013|3cazB|1e-14|8.6|174/207| RP:PDB:REP 997->1155|3dmnA|7e-06|15.1|146/159| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 250->318|PF01695|2e-06|37.7|69/145|IstB| RP:PFM:REP 889->924|PF01443|2e-04|55.9|34/220|Viral_helicase1| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 877->927|PF01443|0.00066|32.0|50/226|Viral_helicase1| HM:PFM:REP 259->303|PF01695|1.2e-07|35.6|45/178|IstB| HM:PFM:REP 1234->1288|PF04480|9.7e-05|30.8|52/109|DUF559| GO:PFM:NREP 2 GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF01695|IPR002611| GO:PFM GO:0004386|"GO:helicase activity"|PF01443|IPR000606| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 260->315|2bhrA2|3e-06|17.9|56/295|c.37.1.14| RP:SCP:REP 757->1108|1t3aA|3e-19|9.9|312/400|d.92.1.7| RP:SCP:REP 1243->1288|1cw0A|4e-06|19.6|46/155|c.52.1.15| HM:SCP:REP 138->333|1z3iX2|1.2e-05|17.6|136/0|c.37.1.19|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| HM:SCP:REP 252->1289|1qhh.1|2.2e-39|23.7|452/0|c.37.1.19|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 214 OP:NHOMOORG 178 OP:PATTERN ----------------1-------------1-111-------1--1-1--111--------1----1- 1------------------------1-------1-1--1------11-11111111-111--------1-1----111----------112---------1----131-----------------11-21-1-----------------1----------------------1------------------1----------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1-1111111-2---111----1----1----------11------1--------------1111-1--11-1------------11-1---1---1-----1-11--------1----1----1-111111-------1----------------------------------1-----111-11--------1----------11-----------1111---------------------1--------1----1-1------------1-1-1-1-------------------1----1---------------21-11-121----1-----1--1---------------2----------------------------------------------------------------------1----------------111----------------------------2111-111-1----1-1------------------------1--1-2----------1-----------------1------11-2211222121111222----1--1----- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-11---3F11-1-----------------------------------------------------1---1------ ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 917 STR:RPRED 71.1 SQ:SECSTR ##################################################################################################################################################################################################################################################################cHHEETTcEEEEEccTTccHHHHHHHHHHHHHTTTccEEEEcTTccccHHHHHHHTTccTTTcEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGEEEEcccccccEEEEEEccHHHHHTHHHHHHHHTTcccHHHHHHHHHTcccccTTcEEEccHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccHHHHGGGccccccccccccccccGGGcGGGGGccGGGcGGccTTccccHHHHHHHHHHHHHHHHTcEEEEEEccccHHHHHHHHHHHGGGcccEEEccTTHHHEEEccccccHHHHccHHHHHHHHHHHHHTTEEEEEEHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHH###############################################################################EHHHHHHHHH#HHHcccHHHHHHHHHHHHHHTccEEEccccccccccccEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccTTTTTTccHHHHHHHHHHTTccEHHHHHHHHHTTccHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcccccccTTHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHcccccTTcHHHHHHHHHHHHccccccEEccccEEcTTcEEEEccccTTTTccTTcEEEEEEEccccEEEEETTEEEEEcGGGGTTEEEccEEEHccHHHTTccEEEEEEEEcGGGGHHHHHHHHHTEEEEEEEEEcHHHHHHHHHcccHHHTTcccccEEEEEccT###TccHHHH#HHHHHHH###HHHccEEEEEcTTGGGGGGTTTTTcccTTcGGGcTTcHHHHHHH##HcHHHHHHHHHHHHHHHHHHH######################### DISOP:02AL 324-335, 1017-1018| PSIPRED cccccccEEEcccccEEEEEccccHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEEEEEEccccccccEEEEEEEEEEEEEEEcccccEEEEEcccccccccHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHccHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEHHHccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEccHHHHHHHHHHcccccccEEEEEccHHccHHHHHHHHHHccEEEEEEcccccccEEEccHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHccccEEEcccccccccccccEEEEEcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHcccccccEEEEccHHcccccccEEEEEEEcccccccccHHHcccccccccHHHHHHHHHHHcccEEEEEcccHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEcccccEEEEEEEEEEccccccEEEEEEEccHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEcHHHHccHHHHHHHHHHHcc //