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Thermus thermophilus HB27 (tthe0)
Gene : AAS80815.1
DDBJ      :             sodium/proline symporter
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  11/68 : Bacteria  406/915 : Eukaryota  4/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:557 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   37->186 3dh4A PDBj 4e-04 22.2 %
:RPS:PFM   33->298,396->483 PF00474 * SSF 1e-20 32.0 %
:HMM:PFM   33->297 PF00474 * SSF 5.3e-37 24.1 253/406  
:HMM:PFM   368->483 PF00474 * SSF 3.1e-24 35.3 116/406  
:BLT:SWISS 8->210,241->470 Y2524_RALEH 5e-39 40.5 %
:PROS 465->485|PS00457|NA_SOLUT_SYMP_2
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAS80815.1 GT:GENE AAS80815.1 GT:PRODUCT sodium/proline symporter GT:DATABASE GIB00176CH01 GT:ORG tthe0 GB:ACCESSION GIB00176CH01 GB:LOCATION complement(454166..455839) GB:FROM 454166 GB:TO 455839 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT sodium/proline symporter GB:PROTEIN_ID AAS80815.1 GB:DB_XREF GI:46196398 LENGTH 557 SQ:AASEQ MSVEAWTWTIVILSFALYLGIGYWARVRETAGFYVAGRGVPPVANGAATAADWMSGASYISMAGLISFLGFDGAVYLMGWTGGYVLLALLLAPYLRKFGRYTVPEFIGDRYYSNLARVVAVIAAIFVSFVYAVPQVRGVGIVLSRYLGVDVATGVWAAVLVTAFIAVLGGMKGITWTQVVQYVVLITAYLIMGIALANLLTGNPIPQLAFTFSDFAVRLSELQVELGFKEYVAPFQNLSALNVFLITLTLMVGTAGLPHVIIRFYTVPKASDARWSAGWALVFIGLLYTTAPAVAVFSKYNLLNTLANKPVEEVRQIDWVQKWEQTGLLKLQDKNGDGILQMSANPDVNEVTIDRDIIVLSTPEVAKLSPFIVGLVAAGGLAAALSTAAGLLIVIASAISHDLYTRLINPGASEATKLLIARVVIFLVVVLAAPFGINPPAFIAQLVAFAFGLAASTFFPAILLGIFDRRMNMQGAVAGMIVGLVFTASYIIGTKYLGWPNFILGITAEGIGAIGMLLNFVVAYLVSRATPPPPEEIQHLVDEIRIPKGSAGSALEH GT:EXON 1|1-557:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 8->210,241->470|Y2524_RALEH|5e-39|40.5|422/683| PROS 465->485|PS00457|NA_SOLUT_SYMP_2|PDOC00429| TM:NTM 13 TM:REGION 5->26| TM:REGION 56->78| TM:REGION 84->96| TM:REGION 118->140| TM:REGION 151->173| TM:REGION 178->200| TM:REGION 243->265| TM:REGION 277->299| TM:REGION 380->402| TM:REGION 412->434| TM:REGION 444->466| TM:REGION 473->495| TM:REGION 504->526| SEG 86->92|llallla| SEG 116->133|arvvaviaaifvsfvyav| SEG 374->392|glvaagglaaalstaagll| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 37->186|3dh4A|4e-04|22.2|144/512| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 33->298,396->483|PF00474|1e-20|32.0|344/401|SSF| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 33->297|PF00474|5.3e-37|24.1|253/406|SSF| HM:PFM:REP 368->483|PF00474|3.1e-24|35.3|116/406|SSF| GO:PFM:NREP 4 GO:PFM GO:0005215|"GO:transporter activity"|PF00474|IPR001734| GO:PFM GO:0006810|"GO:transport"|PF00474|IPR001734| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF00474|IPR001734| GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF00474|IPR001734| OP:NHOMO 636 OP:NHOMOORG 421 OP:PATTERN ---1--------------------1--1--11-------------1-11-----21-------1---- --1--113111111-------1---1------211122341----12--11-111-11--2-2-2344231-----------11-111---------------12---------------------1-1-111-1122222----11-1------------------1112------------11111----1-3333333343333331133123322222331------3-1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-------------1-11211------1--------2211---------11----------------------23222511-----------------21121-22222111-------------421-----------------------------11-1--111112222222222222332222124222432-1221221112242-12231---12----------243-----121-11111-4443343--22421---3--1-----1--1-------12111--11-1111212111111-1111111111111----1-1------11121111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111-1111--111111111111--------------11211111-1---------11211111122222232211132222111---------111121111111111--111111111111--1-------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-----------------------1--------1--------------1---------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 144 STR:RPRED 25.9 SQ:SECSTR ####################################cccccHHHHHHHHHHHHccHHHHTHHHHHHHHTcGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHTTcccHHHHHHHHTcHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHTTccHHHHHHHHHHHHHHTTc######cccHHHHHHHHHH################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 550-557| PSIPRED ccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHccHHHHHHHHHccEEEEEEcccccEEEEccccccccEEEcccEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHccccccccccccc //