[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Thermus thermophilus HB27 (tthe0)
Gene : AAS81266.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  1/68 : Bacteria  216/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1d.282.1
:966 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   1->77 1e69A PDBj 3e-06 37.8 %
:RPS:PDB   1->49 1e69A PDBj 9e-08 43.8 %
:RPS:PDB   26->71 1cjtC PDBj 2e-05 15.2 %
:RPS:PDB   904->965 2bx2L PDBj 3e-04 13.8 %
:RPS:SCOP  2->64 1w1wA  c.37.1.12 * 3e-16 39.7 %
:RPS:SCOP  904->945 1tljA  d.282.1.1 * 2e-05 12.2 %
:HMM:SCOP  1->946 1ii8.1 c.37.1.12 * 7.8e-40 30.5 %
:RPS:PFM   5->49 PF02463 * SMC_N 5e-06 54.5 %
:HMM:PFM   5->947 PF02463 * SMC_N 3.6e-14 32.4 188/220  
:BLT:SWISS 1->148,800->956 RAD50_AQUAE 2e-25 42.5 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAS81266.1 GT:GENE AAS81266.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00176CH01 GT:ORG tthe0 GB:ACCESSION GIB00176CH01 GB:LOCATION complement(902448..905348) GB:FROM 902448 GB:TO 905348 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT hypothetical protein GB:PROTEIN_ID AAS81266.1 GB:DB_XREF GI:46196851 LENGTH 966 SQ:AASEQ MRPLRLELEGFGPYRERQAVDFSDVELFAITGPTGSGKSTLLDAIAFALYGQVPRVGRQVGTLKHPAAAKAWVSLTFRVGERVYRVERSRSEKRGDARVYLLEGGERLLDLPTLEAVNRALADLVGLDYEAFTRALLLPQGEFDRFLKGEPKERRQLLLELFELSRLERARQKAAERRGLLLEEKGRLEGELNGLSAATPEALEELERALAASRAEAARLEEEARGVRKALAEAEALLEDLRRRQALAARLEALKARAEEMARVEERLSRAEEAERALPLWRDYQKKRAALQATEKALEEAEGRLRALEARREALGFSPEALERAQAAYAEAQDLKALEALLARAPAGKAPASGPDPATAQARLEEVLKALEALGAELLRLRAWAEAWEALRAKEAALAEVGEALARLEAEGKEAREARDALALRLKEAEAHALSQALKALEAERKALEKAQEDLDRRREALLREERRLGLLAYHDLLEPGKPCPLCGGVVHALPPLPEVPDLAGARRALEEEAQALARRLARLEAEAGDLAARLRALEVEPRPGDPEALKGALEAAEARLQDLRDRYQALRGEARALEREVAALRAREAEARGGASREDLALRLEAAEARRLALEEEAGRLAAGLRRHLEAKTGGLGVGPYLRRLKEEVERLKGLAAEDARLREEAGALRAELSALRARKEEQAKALAEAEAATRGLMPEAEAQGLALSPGEREALRAELEAFRKDLAEAEAAWRSLPPLSGPAPTLEEAQGRVEVLRKALAELEGRLEEKRKEEGALEDRVERLRKDLARRREVEGALARLVAELALWEKLALDLQAHNFPAYLLGLKQRSLVERASELLYTLSGGRYRFAAQGDEYLVVDLWAEATPRQVRTLSGGESFLASLALALALSEELSRGKLEALFLDEGFGTLDPEALELVAGILESLPTRGRLVGVVTHVEPLAERFPARLRVRKHPWGSRVEWA GT:EXON 1|1-966:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->148,800->956|RAD50_AQUAE|2e-25|42.5|303/978| COIL:NAA 450 COIL:NSEG 9 COIL:REGION 165->193| COIL:REGION 201->268| COIL:REGION 280->318| COIL:REGION 359->470| COIL:REGION 502->541| COIL:REGION 548->593| COIL:REGION 595->628| COIL:REGION 661->694| COIL:REGION 747->794| SEG 78->94|rvgervyrversrsekr| SEG 153->169|errqlllelfelsrler| SEG 176->192|errgllleekgrlegel| SEG 201->225|ealeeleralaasraeaarleeear| SEG 228->277|rkalaeaealledlrrrqalaarlealkaraeemarveerlsraeeaera| SEG 297->316|aleeaegrlralearrealg| SEG 320->338|ealeraqaayaeaqdlkal| SEG 362->434|arleevlkalealgaellrlrawaeawealrakeaalaevgealarleaegkeareardalalrlkeaeahal| SEG 437->451|alkaleaerkaleka| SEG 453->473|edldrrreallreerrlglla| SEG 502->539|dlagarraleeeaqalarrlarleaeagdlaarlrale| SEG 548->561|ealkgaleaaearl| SEG 570->632|alrgearalerevaalrareaearggasredlalrleaaearrlaleeeagrlaaglrrhlea| SEG 656->694|laaedarlreeagalraelsalrarkeeqakalaeaeaa| SEG 713->723|erealraelea| SEG 758->780|lrkalaelegrleekrkeegale| SEG 876->897|lsggesflaslalalalseels| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 1->77|1e69A|3e-06|37.8|74/263| RP:PDB:NREP 3 RP:PDB:REP 1->49|1e69A|9e-08|43.8|48/263| RP:PDB:REP 26->71|1cjtC|2e-05|15.2|46/330| RP:PDB:REP 904->965|2bx2L|3e-04|13.8|58/500| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 5->49|PF02463|5e-06|54.5|44/536|SMC_N| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 5->947|PF02463|3.6e-14|32.4|188/220|SMC_N| GO:PFM:NREP 2 GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF02463|IPR003395| GO:PFM GO:0005694|"GO:chromosome"|PF02463|IPR003395| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 2->64|1w1wA|3e-16|39.7|63/274|c.37.1.12| RP:SCP:REP 904->945|1tljA|2e-05|12.2|41/189|d.282.1.1| HM:SCP:REP 1->946|1ii8.1|7.8e-40|30.5|338/370|c.37.1.12|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 217 OP:NHOMOORG 217 OP:PATTERN -----------------------------------------------1-------------------- ------------------------1-----------1111-111-----11-1---1---111-111111---------1---11--------1-----------1----------------------1-1----1-------------1---------------------------------11111---111111111111111111--111111111111111111111111111111111111111111-------------11----------------------------------------------------------11-------1-11111-111-1---1--1-11----1---111-1---1------------1-------------------------------------1----------1--------------------------------------------------------------------------------------------1111-------1--1------------------------111----1---------------------1---11-----------------------------11--1-11111111--111111111111--1------------11--------------------------------------111-111111111111111---1---------------------------------111-------------------------1-11111111111111111----------111-1111111111--------------------------------------------------------------1-----1---- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 141 STR:RPRED 14.6 SQ:SECSTR cEEEEEEEEccTTccccEEEEcccEcEEEEEccTTTccTHHHHHHHHTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcTccG########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################GGEEEEcccTTHHHHccEEEEEccccccEETTEEcEEEEEEEEEEEccccTTcTTcHccEEEEE# DISOP:02AL 54-64, 146-148, 150-151, 262-277, 288-301, 306-332, 339-354, 408-425, 440-453, 618-631, 662-676, 707-719, 738-751, 766-774, 960-965| PSIPRED cEEEEEEEEEEEcccccEEEccccccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHcccccEEEEEEEEEEcccEEEEEEEEEEEEccEEEEEEEccEEEEEcccHHHHHHHHHHHHcccHHHcccEEEEccccccHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEcccEEEEEEEcccccccHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEccHHHHHHcccEEEEEEcccccEEEEc //