[GTOP]
[HELP]
[ORGANISMS]
[SEARCH]
[SUMMARY]
Family Ranking
This search shows the ranking of the families, frequently appearing in the genome.
ORGANISM:
aaeg0 : Aedes aegypti
aaeo0 : Aquifex aeolicus VF5
aaur0 : Arthrobacter aurescens TC1
aave0 : Acidovorax avenae subsp. citrulli AAC00-1
abac0 : Acidobacteria bacterium Ellin345
abau0 : Acinetobacter baumannii ATCC 17978
abor0 : Alcanivorax borkumensis SK2
acel0 : Acidothermus cellulolyticus 11B
acid0 : Acidovorax sp. JS42
acin0 : Acinetobacter sp. ADP1
acry0 : Acidiphilium cryptum JF-5
adeh0 : Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C
aehr0 : Alkalilimnicola ehrlichei MLHE-1
aful0 : Archaeoglobus fulgidus DSM 4304
afum0 : Aspergillus fumigatus Af293
agam0 : Anopheles gambiae
agos0 : Ashbya gossypii ATCC 10895
ahyd0 : Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966
amar0 : Anaplasma marginale str. St. Maries
amel0 : Apis mellifera
anab0 : Anabaena sp. PCC 7120
anab1 : Anabaena variabilis ATCC 29413
anid0 : Aspergillus nidulans FGSC A4
anig0 : Aspergillus niger ATCC 1015
aper0 : Aeropyrum pernix K1
aper1 : Aeropyrum pernix K1
apha0 : Anaplasma phagocytophilum HZ
aple0 : Actinobacillus pleuropneumoniae L20
arth0 : Arthrobacter sp. FB24
ater0 : Aspergillus terreus
atha0 : Arabidopsis thaliana
atum0 : Agrobacterium tumefaciens str. C58
atum1 : Agrobacterium tumefaciens str. C58
ayel0 : Aster yellows witches'-broom phytoplasma AYWB
azoa0 : Azoarcus sp. EbN1
azoa1 : Azoarcus sp. BH72
babo0 : Brucella abortus biovar 1 str. 9-941
bado0 : Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703
bafz0 : Borrelia afzelii PKo
bant0 : Bacillus anthracis str. Ames
bant1 : Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'
bant2 : Bacillus anthracis str. Sterne
baph0 : Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum)
baph1 : Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae)
baph2 : Buchnera aphidicola str. Cc (Cinara cedri)
bavi0 : Bordetella avium 197N
bbac0 : Bdellovibrio bacteriovorus HD100
bbac1 : Bartonella bacilliformis KC583
bbro0 : Bordetella bronchiseptica RB50
bbur0 : Borrelia burgdorferi B31
bcen0 : Burkholderia cenocepacia AU 1054
bcen1 : Burkholderia cenocepacia HI2424
bcep0 : Burkholderia cepacia AMMD
bcer0 : Bacillus cereus ATCC 14579
bcer1 : Bacillus cereus ATCC 10987
bcer2 : Bacillus cereus E33L
bcic0 : Baumannia cicadellinicola Hc (Homalodisca coagulata)
bcin0 : Botryotinia fuckeliana B05.10
bcla0 : Bacillus clausii KSM-K16
bden0 : Batrachochytrium dendrobatidis
bflo0 : Candidatus Blochmannia floridanus
bflo1 : Branchiostoma floridae
bfra0 : Bacteroides fragilis YCH46
bfra1 : Bacteroides fragilis NCTC 9343
bgar0 : Borrelia garinii PBi
bhal0 : Bacillus halodurans C-125
bhen0 : Bartonella henselae Houston-1
bjap0 : Bradyrhizobium japonicum USDA 110
blic0 : Bacillus licheniformis DSM 13
blic1 : Bacillus licheniformis ATCC 14580
blon0 : Bifidobacterium longum NCC2705
bmal0 : Burkholderia mallei ATCC 23344
bmal1 : Burkholderia mallei NCTC 10229
bmal2 : Burkholderia mallei NCTC 10247
bmal3 : Burkholderia mallei SAVP1
bmel0 : Brucella melitensis 16M
bmel1 : Brucella melitensis biovar Abortus
bmor0 : Bombyx mori
bp180 : Enterobacteria phage 186
bp440 : Staphylococcus phage 44AHJD
bp441 : Bacteriophage 44RR2.8t
bp470 : Phage phi 4795
bp770 : Bacteriophage 77
bp930 : Bacteriophage 933W
bpa10 : Bacteriophage A118
bpa50 : Bacteriophage A511
bpaa0 : Bacteriophage Aaphi23
bpae0 : Bacteriophage Aeh1
bpap0 : Acyrthosiphon pisum bacteriophage APSE-1
bpar0 : Bordetella parapertussis 12822
bpb10 : Bacteriophage B1
bpb11 : Bacteriophage B103
bpba0 : Mycobacteriophage Barnyard
bpbc0 : Burkholderia cepacia phage Bcep781
bpbc1 : Burkholderia cepacia phage Bcep1
bpbc2 : Burkholderia cepacia phage Bcep22
bpbc3 : Burkholderia cepacia phage Bcep43
bpbc4 : Burkholderia cenocepacia phage BcepMu
bpbc5 : Burkholderia cenocepacia phage BcepB1A
bpbc6 : Burkholderia cepacia complex phage BcepC6B
bpbc7 : Burkholderia cepacia phage BcepNazgul
bpbf0 : Enterobacteria phage BF23
bpbi0 : Bacteriophage bIL170
bpbi1 : Bacteriophage bIL285
bpbi2 : Bacteriophage bIL286
bpbi3 : Bacteriophage bIL309
bpbi4 : Bacteriophage bIL310
bpbi5 : Bacteriophage bIL311
bpbi6 : Bacteriophage bIL312
bpbi7 : Bordetella phage BIP-1
bpbk0 : Lactococcus phage BK5-T
bpbm0 : Bordetella phage BMP-1
bpbp0 : Bordetella phage BPP-1
bpbx0 : Mycobacteriophage Bxb1
bpbx1 : Mycobacteriophage Bxz1
bpbx2 : Mycobacteriophage Bxz2
bpc10 : Streptococcus phage C1
bpc20 : Lactococcus phage c2
bpch0 : Mycobacteriophage Che8
bpch1 : Mycobacteriophage Che9c
bpch2 : Mycobacteriophage Che9d
bpcj0 : Mycobacteriophage CJW1
bpco0 : Mycobacteriophage Corndog
bpcp0 : Streptococcus phage Cp-1
bpct0 : Pseudomonas aeruginosa phage phi CTX Viruses.
bpd20 : Mycobacteriophage D29
bpd30 : Pseudomonas phage D3
bpd31 : Bacteriophage D3112
bpeh0 : Emiliania huxleyi virus 86
bpej0 : Bacteriophage EJ-1
bpen0 : Candidatus Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN
bpep0 : Enterobacteria phage epsilon15
bper0 : Bordetella pertussis Tohama I
bpes0 : Salmonella typhimurium bacteriophage ES18
bpes1 : Ectocarpus siliculosus virus 1
bpfe0 : Bacteriophage Felix 01
bpg10 : Bacteriophage phig1e Viruses.
bpga0 : Bacillus phage GA-1
bpgh0 : Pseudomonas phage gh-1
bph10 : Bacteriophage H-19B
bphf0 : Halovirus HF2
bphk0 : Enterobacteria phage HK022
bphk1 : Bacteriophage HK620
bphk2 : Bacteriophage HK97
bphp0 : Haemophilus phage HP1
bphp1 : Haemophilus phage HP2
bpk_0 : Staphylococcus phage K Viruses.
bpk10 : Bacteriophage K139
bpks0 : Bacteriophage KS7
bpkv0 : Bacteriophage KVP40
bpl20 : Listeria phage 2389
bpl40 : Bacteriophage L-413C
bpl50 : Mycobacterium phage L5
bpla0 : bacteriophage lambda
bplc0 : Lactobacillus casei bacteriophage A2
bplj0 : Lactobacillus johnsonii prophage Lj928
bplj1 : Lactobacillus johnsonii prophage Lj965
bpma0 : Mycoplasma arthritidis bacteriophage MAV1
bpmi0 : Acanthamoeba polyphaga mimivirus
bpmu0 : Enterobacteria phage Mu
bpmx0 : Bacteriophage Mx8
bpn10 : Bacteriophage N15
bpom0 : Mycobacteriophage Omega
bpp10 : Mycoplasma virus P1
bpp11 : Enterobacteria phage P1
bpp20 : Enterobacteria phage P2
bpp21 : Enterobacteria phage P22
bpp22 : Bacteriophage P27
bpp30 : Lactococcus phage P335
bpp40 : Bacteriophage P4
bpp60 : Cyanophage P60
bppa0 : PA01
bppa1 : Pseudomonas aeruginosa phage PaP3
bppa2 : Pseudomonas aeruginosa bacteriophage PaP2
bppb0 : Sinorhizobium meliloti phage PBC5
bppg0 : Mycobacteriophage PG1
bpph0 : Pseudomonas phage phiKZ
bpph1 : Virus PhiCh1
bpph2 : Bacteriophage phiYeO3-12
bpph3 : Bacteriophage phi-105
bpph4 : Bacteriophage phi-C31
bpph5 : Bacteriophage phi3626
bpph6 : Bacteriophage phiE125
bpph7 : Bacteriophage phi ETA
bpph8 : Temperate phage PhiNIH1.1
bpph9 : Staphylococcus aureus prophage phiPV83
bpphA : Staphylococcus aureus temperate phage phiSLT
bpphB : Lactobacillus bacteriophage phi adh
bpphC : Bacteriophage phi-BT1
bpphD : Yersinia pestis phage phiA1122
bpphE : Staphylococcus aureus phage phiP68
bpphF : bacteriophage phiKMV
bpphG : Bacteriophage phi1026b
bpphH : Staphylococcus aureus phage phi 11
bpphI : Staphylococcus aureus phage phi 12
bpphJ : Staphylococcus aureus phage phi 13
bpphK : Listonella pelagia phage phiHSIC
bppj0 : Bacteriophage phi JL001
bppk0 : Bacteriophage phiKO2
bppl0 : Bacteriophage phi LC3
bppm0 : Alteromonas phage PM2
bppm1 : ¦ÕMFV1
bppr0 : Enterobacteria phage PRD1
bpps0 : Methanobacterium phage psiM2
bpps1 : Methanothermobacter wolfeii prophage psiM100
bpps2 : Bacteriophage PSP3
bpps3 : Cyanophage P-SSM2
bpps4 : Cyanophage P-SSM4
bpps5 : Cyanophage P-SSP7
bppy0 : Bacteriophage PY54
bppz0 : Bacillus phage PZA
bpr10 : Bacteriophage r1t
bprb0 : RB69
bprb1 : Enterobacteria phage RB49
bprb2 : Paramecium bursaria Chlorella virus 1
bprd0 : Rd
bprm0 : Bacteriophage RM 378
bpro0 : Mycobacteriophage Rosebush
bpsa0 : Staphylococcus aureus bacteriophage PVL
bpse0 : Burkholderia pseudomallei K96243
bpse1 : Burkholderia pseudomallei 1710b
bpse2 : Burkholderia pseudomallei 1106a
bpse3 : Burkholderia pseudomallei 668
bpsf0 : Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11
bpsf1 : Shigella flexneri bacteriophage V
bpsf2 : Enterobacteria phage Sf6
bpsi0 : Roseophage SIO1
bpsk0 : Bacteriophage sk1
bpsm0 : Streptococcus mitis phage SM1
bpsp0 : Enterobacteria phage SP6
bpsp1 : Bacteriophage SPBc2
bpsp2 : Bacteriophage SPP1
bpsp3 : Streptococcus pneumoniae bacteriophage MM1
bpsp4 : S-PM2
bpst0 : Salmonella typhimurium phage ST64B
bpst1 : Salmonella typhimurium bacteriophage ST64T
bpst2 : Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201
bpst3 : Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1
bpst4 : Streptococcus thermophilus temperate bacteriophage O1205
bpst5 : Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19
bpst6 : Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21
bpst7 : Stx2 converting bacteriophage I
bpst8 : Stx1 converting bacteriophage
bpst9 : Stx2 converting bacteriophage II
bpt10 : Enterobacteria phage T1
bpt30 : T3
bpt40 : Enterobacteria phage T4
bpt50 : Bacteriophage T5
bpt70 : Enterobacteria phage T7
bptm0 : Mycobacteriophage TM4
bptp0 : Lactococcus lactis bacteriophage TP901-1
bptu0 : Bacteriophage Tuc2009
bpul0 : Lactococcus lactis bacteriophage ul36
bpvh0 : Vibrio harveyi bacteriophage VHML
bpvp0 : Vibriophage VpV262
bpvp1 : Vibriophage VP5
bpvp2 : Vibriophage VP2
bpvt0 : Bacteriophage VT2-Sa
bpvw0 : Bacteriophage VWB
bpwp0 : Bacteriophage WPhi
bpxp0 : Xanthomonas oryzae bacteriophage Xp10
bqui0 : Bartonella quintana str. Toulouse
brad0 : Bradyrhizobium sp. ORS278
bsub0 : Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168
bsui0 : Brucella suis 1330
btau0 : Bos taurus
btha0 : Burkholderia thailandensis E264
bthe0 : Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482
bthu0 : Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27
bthu1 : Bacillus thuringiensis str. Al Hakam
btur0 : Borrelia turicatae 91E135
buch0 : Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum)
burk0 : Burkholderia sp. 383
bvie0 : Burkholderia vietnamiensis G4
bxen0 : Burkholderia xenovorans LB400
cabo0 : Chlamydophila abortus S26/3
cace0 : Clostridium acetobutylicum ATCC 824
calb0 : Candida albicans
cbri0 : Caenorhabditis briggsae
cbur0 : Coxiella burnetii RSA 493
ccav0 : Chlamydophila caviae GPIC
cchl0 : Chlorobium chlorochromatii CaD3
ccin0 : Coprinus cinereus
ccre0 : Caulobacter crescentus CB15
cdif0 : Clostridium difficile 630
cdip0 : Corynebacterium diphtheriae NCTC 13129
ceff0 : Corynebacterium efficiens YS-314
cele0 : Caenorhabditis elegans
cfam0 : Canis familiaris
cfel0 : Chlamydophila felis Fe/C-56
cfet0 : Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40
cgla0 : Candida glabrata
cglo0 : Chaetomium globosum CBS 148.51
cglu0 : Corynebacterium glutamicum ATCC 13032
cglu1 : Corynebacterium glutamicum ATCC 13032
cgui0 : Candida guilliermondii
chom0 : Cryptosporidium hominis TU502
chut0 : Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406
chyd0 : Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901
cimm0 : Coccidioides immitis RS
cint0 : Ciona intestinalis
cjei0 : Corynebacterium jeikeium K411
cjei1 : Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176
cjej0 : Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168
cjej1 : Campylobacter jejuni RM1221
clus0 : Candida lusitaniae
cmag0 : Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)
cmer0 : Cyanidioschyzon merolae strain 10D
cmur0 : Chlamydia muridarum Nigg
cneo0 : Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21
cnov0 : Clostridium novyi NT
cpar0 : Cryptosporidium parvum
cper0 : Clostridium perfringens str. 13
cper1 : Clostridium perfringens ATCC 13124
cper2 : Clostridium perfringens SM101
cpha0 : Chlorobium phaeobacteroides DSM 266
cpne0 : Chlamydophila pneumoniae AR39
cpne1 : Chlamydophila pneumoniae CWL029
cpne2 : Chlamydophila pneumoniae J138
cpne3 : Chlamydophila pneumoniae TW-183
cpor0 : Cavia porcellus
cpsy0 : Colwellia psychrerythraea 34H
crei0 : Chlamydomonas reinhardtii
crud0 : Candidatus Carsonella ruddii PV
csac0 : Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903
csal0 : Chromohalobacter salexigens DSM 3043
csav0 : Ciona savignyi
csym0 : Cenarchaeum symbiosum
ctep0 : Chlorobium tepidum TLS
ctet0 : Clostridium tetani E88
cthe0 : Clostridium thermocellum ATCC 27405
ctra0 : Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX
ctra1 : Chlamydia trachomatis A/HAR-13
ctro0 : Candida tropicalis
cves0 : Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA
cvio0 : Chromobacterium violaceum ATCC 12472
cyel0 : Synechococcus sp. JA-3-3Ab
cyel1 : Synechococcus sp. JA-2-3B'a(2-13)
daro0 : Dechloromonas aromatica RCB
ddes0 : Desulfovibrio desulfuricans G20
ddis0 : Dictyostelium discoideum AX4
deha0 : Dehalococcoides sp. CBDB1
deha1 : Dehalococcoides sp. BAV1
deth0 : Dehalococcoides ethenogenes 195
dgeo0 : Deinococcus geothermalis DSM 11300
dhaf0 : Desulfitobacterium hafniense Y51
dhan0 : Debaryomyces hansenii CBS767
dmel0 : Drosophila melanogaster
dnod0 : Dichelobacter nodosus VCS1703A
dnov0 : Dasypus novemcinctus
dpsy0 : Desulfotalea psychrophila LSv54
drad0 : Deinococcus radiodurans R1
dred0 : Desulfotomaculum reducens MI-1
drer0 : Danio rerio
dvul0 : Desulfovibrio vulgaris subsp. vulgaris str. Hildenborough
dvul1 : Desulfovibrio vulgaris subsp. vulgaris DP4
ecan0 : Ehrlichia canis str. Jake
ecar0 : Erwinia carotovora subsp. atroseptica SCRI1043
echa0 : Ehrlichia chaffeensis Arkansas
ecol0 : Escherichia coli K12 MG1655
ecol1 : Escherichia coli O157:H7
ecol2 : Escherichia coli O157:H7 EDL933
ecol3 : Escherichia coli CFT073
ecol4 : Escherichia coli K12 W3110
ecol5 : Escherichia coli UTI89
ecol6 : Escherichia coli 536
ecol7 : Escherichia coli APEC O1
ecun0 : Encephalitozoon cuniculi GB-M1
efae0 : Enterococcus faecalis V583
elit0 : Erythrobacter litoralis HTCC2594
ente0 : Enterobacter sp. 638
erum0 : Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden
erum1 : Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden
erum2 : Ehrlichia ruminantium str. Gardel
etel0 : Echinops telfairi
faln0 : Frankia alni ACN14a
fcat0 : Felis catus
fgra0 : Fusarium verticillioides
fjoh0 : Flavobacterium johnsoniae UW101
fnuc0 : Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586
foxy0 : Fusarium oxysporum
fran0 : Frankia sp. CcI3
ftul0 : Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4
ftul1 : Francisella tularensis subsp. holarctica LVS
ftul2 : Francisella tularensis subsp. tularensis FSC 198
ftul3 : Francisella tularensis subsp. holarctica OSU18
ftul4 : Francisella tularensis subsp. novicida U112
ftul5 : Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418
fver0 : Fusarium verticillioides
gacu0 : Gasterosteus aculeatus
gbet0 : Granulibacter bethesdensis CGDNIH1
gfor0 : Gramella forsetii KT0803
ggal0 : Gallus gallus
gint0 : Giardia lamblia ATCC 50803
gkau0 : Geobacillus kaustophilus HTA426
gmet0 : Geobacter metallireducens GS-15
goxy0 : Gluconobacter oxydans 621H
gsul0 : Geobacter sulfurreducens PCA
gthe0 : Guillardia theta
gura0 : Geobacter uraniumreducens Rf4
gvio0 : Gloeobacter violaceus PCC 7421
gzea0 : Gibberella zeae PH-1
haci0 : Helicobacter acinonychis Sheeba
halo0 : Halobacterium sp. NRC-1
hbut0 : Hyperthermus butylicus DSM 5456
hcap0 : Histoplasma capsulatum
hche0 : Hahella chejuensis KCTC 2396
hduc0 : Haemophilus ducreyi 35000HP
hhal0 : Halorhodospira halophila SL1
hhep0 : Helicobacter hepaticus ATCC 51449
hinf0 : Haemophilus influenzae Rd
hinf1 : Haemophilus influenzae 86-028NP
hmar0 : Haloarcula marismortui ATCC 43049
hnep0 : Hyphomonas neptunium ATCC 15444
hpyl0 : Helicobacter pylori 26695
hpyl1 : Helicobacter pylori J99
hpyl2 : Helicobacter pylori HPAG1
hsap0 : Homo sapiens
hsap1 : Homo sapiens
hsap2 : Homo sapiens
hsom0 : Haemophilus somnus 129PT
huge0 : Homo sapiens cDNA
hwal0 : Haloquadratum walsbyi DSM 16790
iloi0 : Idiomarina loihiensis L2TR
jann0 : Jannaschia sp. CCS1
klac0 : Kluyveromyces lactis
laci0 : Lactobacillus acidophilus NCFM
lafr0 : Loxodonta africana
lbic0 : Laccaria bicolor
lbor0 : Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197
lbor1 : Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550
lbre0 : Lactobacillus brevis ATCC 367
lbul0 : Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC 11842
lcas0 : Lactobacillus casei ATCC 334
ldel0 : Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC BAA-365
lelo0 : Lodderomyces elongisporus
lgas0 : Lactobacillus gasseri ATCC 33323
linn0 : Listeria innocua
lint0 : Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601
lint1 : Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130
lint2 : Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00
ljoh0 : Lactobacillus johnsonii NCC 533
llac0 : Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403
llac1 : Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11
llac2 : Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363
lmaj0 : Leishmania major strain Friedlin
lmes0 : Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293
lmon0 : Listeria monocytogenes Clip11262
lmon1 : Listeria monocytogenes str. 4b F2365
lpla0 : Lactobacillus plantarum WCFS1
lpne0 : Legionella pneumophila str. Lens
lpne1 : Legionella pneumophila str. Paris
lpne2 : Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1
lsak0 : Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K
lsal0 : Lactobacillus salivarius subsp. salivarius UCC118
lwel0 : Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334
lxyl0 : Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07
mace0 : Methanosarcina acetivorans C2A
magn0 : Magnetococcus sp. MC-1
maqu0 : Marinobacter aquaeolei VT8
maqu1 : Mycobacterium avium 104
mavi0 : Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10
mbar0 : Methanosarcina barkeri str. fusaro
mbov0 : Mycobacterium bovis AF2122/97
mbov1 : Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2
mbre0 : Monosiga brevicollis
mbur0 : Methanococcoides burtonii DSM 6242
mcap0 : Methylococcus capsulatus str. Bath
mcap1 : Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343
mdom0 : Monodelphis domestica
meso0 : Mesorhizobium sp. BNC1
mfla0 : Methylobacillus flagellatus KT
mflo0 : Mesoplasma florum L1
mgal0 : Mycoplasma gallisepticum R
mgen0 : Mycoplasma genitalium G-37
mgil0 : Mycobacterium gilvum PYR-GCK
mgra0 : Mycosphaerella graminicola
mgri0 : Magnaporthe grisea 70-15
mhun0 : Methanospirillum hungatei JF-1
mhyo0 : Mycoplasma hyopneumoniae 232
mhyo1 : Mycoplasma hyopneumoniae 7448
mhyo2 : Mycoplasma hyopneumoniae J
mjan0 : Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661
mkan0 : Methanopyrus kandleri AV19
mlab0 : Methanocorpusculum labreanum Z
mlep0 : Mycobacterium leprae TN
mlot0 : Mesorhizobium loti MAFF303099
mluc0 : Myotis lucifugus
mmag0 : Magnetospirillum magneticum AMB-1
mmar0 : Methanococcus maripaludis S2
mmar1 : Methanococcus maripaludis C5
mmar2 : Methanoculleus marisnigri JR1
mmar3 : Maricaulis maris MCS10
mmaz0 : Methanosarcina mazei Goe1
mmob0 : Mycoplasma mobile 163K
mmul0 : Macaca mulatta
mmus0 : Mus musculus
mmyc0 : Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC
mpen0 : Mycoplasma penetrans HF-2
mpet0 : Methylibium petroleiphilum PM1
mpne0 : Mycoplasma pneumoniae M129
mpul0 : Mycoplasma pulmonis UAB CTIP
msed0 : Metallosphaera sedula DSM 5348
msme0 : Mycobacterium smegmatis str. MC2 155
msta0 : Methanosphaera stadtmanae DSM 3091
msuc0 : Mannheimia succiniciproducens MBEL55E
msyn0 : Mycoplasma synoviae 53
mthe0 : Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H
mthe1 : Moorella thermoacetica ATCC 39073
mthe2 : Methanosaeta thermophila PT
mtub0 : Mycobacterium tuberculosis H37Rv
mtub1 : Mycobacterium tuberculosis CDC1551
mulc0 : Mycobacterium ulcerans Agy99
mvan0 : Mycobacterium vanbaalenii PYR-1
mxan0 : Myxococcus xanthus DK 1622
myco0 : Mycobacterium sp. MCS
myco1 : Mycobacterium sp. JLS
myco2 : Mycobacterium sp. KMS
naro0 : Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444
ncas0 : Naumovia castellii
ncra0 : Neurospora crassa OR74A
nequ0 : Nanoarchaeum equitans Kin4-M
neur0 : Nitrosomonas europaea ATCC 19718
nfar0 : Nocardia farcinica IFM 10152
ngon0 : Neisseria gonorrhoeae FA 1090
ngru0 : Naegleria gruberi
nhae0 : Nectria haematococca
nham0 : Nitrobacter hamburgensis X14
nmen0 : Neisseria meningitidis MC58
nmen1 : Neisseria meningitidis Z2491
nmen2 : Neisseria meningitidis FAM18
nmul0 : Nitrosospira multiformis ATCC 25196
noca0 : Nocardioides sp. JS614
noce0 : Nitrosococcus oceani ATCC 19707
npha0 : Natronomonas pharaonis DSM 2160
nsen0 : Neorickettsia sennetsu str. Miyayama
nuet0 : Nitrosomonas eutropha C91
nvec0 : Nematostella vectensis
nwin0 : Nitrobacter winogradskyi Nb-255
oana0 : Ornithorhynchus anatinus
ocun0 : Oryctolagus cuniculus
ogar0 : Otolemur garnettii
oihe0 : Oceanobacillus iheyensis HTE831
olat0 : Oryzias latipes
oluc0 : Ostreococcus lucimarinus
ooen0 : Oenococcus oeni PSU-1
osat0 : Oryza sativa (japonica cultivar-group)
osat1 : Oryza sativa cDNA(japonica cultivar-group)
otau0 : Ostreococcus tauri
otsu0 : Orientia tsutsugamushi Boryong
paby0 : Pyrococcus abyssi Orsay
pacn0 : Propionibacterium acnes KPA171202
paer0 : Pseudomonas aeruginosa PAO1
paer1 : Pyrobaculum aerophilum str. IM2
paer2 : Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14
para0 : Parachlamydia sp. UWE25
parc0 : Psychrobacter arcticus 273-4
pars0 : Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514
past0 : Onion yellows phytoplasma OY-M
patl0 : Pseudoalteromonas atlantica T6c
pbla0 : Phycomyces blakesleeanus
pcal0 : Pyrobaculum calidifontis JCM 11548
pcar0 : Pelobacter carbinolicus DSM 2380
pchr0 : Phanerochaete chrysosporium RP-78
pcry0 : Psychrobacter cryohalolentis K5
pden0 : Paracoccus denitrificans PD1222
pent0 : Pseudomonas entomophila L48
pfal0 : Plasmodium falciparum 3D7
pflu0 : Pseudomonas fluorescens Pf-5
pflu1 : Pseudomonas fluorescens PfO-1
pfur0 : Pyrococcus furiosus DSM 3638
pgin0 : Porphyromonas gingivalis W83
phal0 : Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125
phor0 : Pyrococcus horikoshii OT3
pinf0 : Phytophthora infestans
ping0 : Psychromonas ingrahamii 37
pisl0 : Pyrobaculum islandicum DSM 4184
plum0 : Photorhabdus luminescens subsp. laumondii TTO1
plut0 : Pelodictyon luteolum DSM 273
pmar0 : Prochlorococcus marinus subsp. pastoris str. CCMP1986
pmar1 : Prochlorococcus marinus str. MIT 9313
pmar2 : Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375
pmar3 : Prochlorococcus marinus str. NATL2A
pmar4 : Prochlorococcus marinus str. MIT 9312
pmar5 : Prochlorococcus marinus str. AS9601
pmar6 : Prochlorococcus marinus str. MIT 9301
pmar7 : Prochlorococcus marinus str. MIT 9303
pmar8 : Prochlorococcus marinus str. MIT 9515
pmar9 : Prochlorococcus marinus str. NATL1A
pmen0 : Pseudomonas mendocina ymp
pmul0 : Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70
pnap0 : Polaromonas naphthalenivorans CJ2
pola0 : Polaromonas sp. JS666
poly0 : Polynucleobacter sp. QLW-P1DMWA-1
ppen0 : Pediococcus pentosaceus ATCC 25745
ppro0 : Photobacterium profundum ss9
ppro1 : Pelobacter propionicus DSM 2379
pput0 : Pseudomonas putida KT2440
pram0 : Phytophthora ramorum
psoj0 : Phytophthora sojae
psti0 : Pichia stipitis CBS 6054
pstu0 : Pseudomonas stutzeri A1501
psyr0 : Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000
psyr1 : Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A
psyr2 : Pseudomonas syringae pv. syringae B728a
pthe0 : Pelotomaculum thermopropionicum SI
ptor0 : Picrophilus torridus DSM 9790
ptri0 : Phaeodactylum tricornutum
ptri1 : Populus trichocarpa
ptro0 : Pan troglodytes
pubi0 : Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062
pyoe0 : Plasmodium yoelii yoeliia str. 17XNL
rbal0 : Pirellula sp. 1
rbel0 : Rickettsia bellii RML369-C
rcon0 : Rickettsia conorii str. Malish 7
rden0 : Roseobacter denitrificans OCh 114
retl0 : Rhizobium etli CFN 42
reut0 : Ralstonia eutropha JMP134
reut1 : Ralstonia eutropha H16
rfel0 : Rickettsia felis URRWXCal2
rfer0 : Rhodoferax ferrireducens DSM 15236
rhod0 : Rhodococcus sp. RHA1
rleg0 : Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841
rmet0 : Ralstonia metallidurans CH34
rnor0 : Rattus norvegicus
rory0 : Rhizopus oryzae RA 99-880
rpal0 : Rhodopseudomonas palustris CGA009
rpal1 : Rhodopseudomonas palustris BisB18
rpal2 : Rhodopseudomonas palustris BisB5
rpal3 : Rhodopseudomonas palustris HaA2
rpal4 : Rhodopseudomonas palustris BisA53
rpro0 : Rickettsia prowazekii Madrid E
rrub0 : Rhodospirillum rubrum ATCC 11170
rsol0 : Ralstonia solanacearum GMI1000
rsph0 : Rhodobacter sphaeroides 2.4.1
rsph1 : Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029
rsph2 : Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025
rtyp0 : Rickettsia typhi str. Wilmington
rxyl0 : Rubrobacter xylanophilus DSM 9941
saci0 : Sulfolobus acidocaldarius DSM 639
saci1 : Syntrophus aciditrophicus SB
saga0 : Streptococcus agalactiae 2603V/R
saga1 : Streptococcus agalactiae NEM316
saga2 : Streptococcus agalactiae A909
sala0 : Sphingopyxis alaskensis RB2256
sama0 : Shewanella amazonensis SB2B
saur0 : Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50
saur1 : Staphylococcus aureus subsp. aureus N315
saur2 : Staphylococcus aureus subsp. aureus MW2
saur3 : Staphylococcus aureus subsp. aureus MRSA252
saur4 : Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476
saur5 : Staphylococcus aureus subsp. aureus COL
saur6 : Staphylococcus aureus RF122
saur7 : Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325
saur8 : Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300
saur9 : Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9
save0 : Streptomyces avermitilis MA-4680
sbal0 : Shewanella baltica OS155
sbay0 : Saccharomyces bayanus
sboy0 : Shigella boydii Sb227
scer0 : Saccharomyces cerevisiae
scoe0 : Streptomyces coelicolor A3(2)
sdeg0 : Saccharophagus degradans 2-40
sden0 : Shewanella denitrificans OS217
sdys0 : Shigella dysenteriae Sd197
selo0 : Synechococcus elongatus PCC 6301
selo1 : Synechococcus elongatus PCC 7942
sepi0 : Staphylococcus epidermidis ATCC 12228
sepi1 : Staphylococcus epidermidis RP62A
sery0 : Saccharopolyspora erythraea NRRL 2338
sfle0 : Shigella flexneri 2a str. 301
sfle1 : Shigella flexneri 2a str. 2457T
sfle2 : Shigella flexneri 5 8401
sfri0 : Shewanella frigidimarina NCIMB 400
sfum0 : Syntrophobacter fumaroxidans MPOB
sglo0 : Sodalis glossinidius str. 'morsitans'
shae0 : Staphylococcus haemolyticus JCSC1435
shew0 : Shewanella sp. ANA-3
shew1 : Shewanella sp. MR-4
shew2 : Shewanella sp. MR-7
shew3 : Shewanella sp. W3-18-1
sili0 : Silicibacter sp. TM1040
sjap0 : Schizosaccharomyces japonicus
sklu0 : Saccharomyces kluyveri
skud0 : Saccharomyces kudriavzevii
sloi0 : Shewanella loihica PV-4
smar0 : Staphylothermus marinus F1
smel0 : Sinorhizobium meliloti 1021
smik0 : Saccharomyces mikatae
smut0 : Streptococcus mutans UA159
snod0 : Phaeosphaeria nodorum SN15
sone0 : Shewanella oneidensis MR-1
spar0 : Saccharomyces paradoxus
spne0 : Streptococcus pneumoniae TIGR4
spne1 : Streptococcus pneumoniae R6
spne2 : Streptococcus pneumoniae D39
spom0 : Schizosaccharomyces pombe 972h-
spom1 : Silicibacter pomeroyi DSS-3
sput0 : Shewanella putrefaciens CN-32
spyo0 : Streptococcus pyogenes M1 GAS
spyo1 : Streptococcus pyogenes MGAS8232
spyo2 : Streptococcus pyogenes MGAS315
spyo3 : Streptococcus pyogenes SSI-1
spyo4 : Streptococcus pyogenes MGAS10394
spyo5 : Streptococcus pyogenes MGAS5005
spyo6 : Streptococcus pyogenes MGAS6180
spyo7 : Streptococcus pyogenes MGAS10270
spyo8 : Streptococcus pyogenes MGAS10750
spyo9 : Streptococcus pyogenes MGAS2096
spyoA : Streptococcus pyogenes MGAS9429
spyoB : Streptococcus pyogenes str. Manfredo
sros0 : Sporobolomyces roseus
srub0 : Salinibacter ruber DSM 13855
ssan0 : Streptococcus sanguinis SK36
ssap0 : Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305
sscl0 : Sclerotinia sclerotiorum 1980
ssol0 : Sulfolobus solfataricus P2
sson0 : Shigella sonnei Ss046
ssui0 : Streptococcus suis 05ZYH33
ssui1 : Streptococcus suis 98HAH33
sthe0 : Streptococcus thermophilus CNRZ1066
sthe1 : Streptococcus thermophilus LMG 18311
sthe2 : Streptococcus thermophilus LMD-9
stok0 : Sulfolobus tokodaii str. 7
stri0 : Spermophilus tridecemlineatus
stro0 : Salinispora tropica CNB-440
styp0 : Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18
styp1 : Salmonella typhimurium LT2
styp2 : Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi Ty2
styp3 : Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150
styp4 : Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67
susi0 : Solibacter usitatus Ellin6076
swol0 : Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen
symb0 : Symbiobacterium thermophilum IAM14863
syne0 : Synechocystis sp. PCC 6803
syne1 : Synechococcus sp. WH 8102
syne2 : Synechococcus sp. CC9902
syne3 : Synechococcus sp. CC9605
syne4 : Synechococcus sp. CC9311
syne5 : Synechococcus sp. WH 7803
taci0 : Thermoplasma acidophilum DSM1728
tbel0 : Tupaia belangeri
tbru0 : Trypanosoma brucei TREU927
tcru0 : Thiomicrospira crunogena XCL-2
tden0 : Treponema denticola ATCC 35405
tden1 : Thiobacillus denitrificans ATCC 25259
tden2 : Thiomicrospira denitrificans ATCC 33889
telo0 : Thermosynechococcus elongatus BP-1
tery0 : Trichodesmium erythraeum IMS101
tfus0 : Thermobifida fusca YX
tkod0 : Thermococcus kodakarensis KOD1
tmar0 : Thermotoga maritima MSB8
tnig0 : Tetraodon nigroviridis
tpal0 : Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols
tpen0 : Thermofilum pendens Hrk 5
tpet0 : Thermotoga petrophila RKU-1
tpse0 : Thalassiosira pseudonana CCMP1335
tree0 : Trichoderma reesei QM9414
trub0 : Fugu rubripes
tten0 : Thermoanaerobacter tengcongensis MB4
tthe0 : Thermus thermophilus HB27
tthe1 : Thermus thermophilus HB8
tvol0 : Thermoplasma volcanium GSS1
twhi0 : Tropheryma whipplei TW08/27
twhi1 : Tropheryma whipplei str. Twist
umay0 : Ustilago maydis 521
uree0 : Uncinocarpus reesii
uure0 : Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970
vcho0 : Vibrio cholerae O1 biovar eltor str. N16961
vcho1 : Vibrio cholerae O395
veis0 : Verminephrobacter eiseniae EF01-2
vfis0 : Vibrio fischeri ES114
vpar0 : Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633
vvul0 : Vibrio vulnificus CMCP6
vvul1 : Vibrio vulnificus YJ016
wbre0 : Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis
wend0 : Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster
wend1 : Wolbachia endosymbiont strain TRS of Brugia malayi
wsuc0 : Wolinella succinogenes DSMZ 1740
xaxo0 : Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306
xcam0 : Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913
xcam1 : Xanthomonas campestris pv. vesicatoria
xcam2 : Xanthomonas campestris pv. campestris str. 8004
xfas0 : Xylella fastidiosa 9a5c
xfas1 : Xylella fastidiosa Temecula1
xory0 : Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC10331
xory1 : Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018
xtro0 : Xenopus tropicalis
yent0 : Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081
ylip0 : Yarrowia lipolytica CLIB122
ypes0 : Yersinia pestis CO92
ypes1 : Yersinia pestis KIM
ypes2 : Yersinia pestis biovar Medievalis str. 91001
ypes3 : Yersinia pseudotuberculosis IP 32953
ypes4 : Yersinia pestis Antiqua
ypes5 : Yersinia pestis Nepal516
zmob0 : Zymomonas mobilis ZM4
FAMILY
SCOP/fold
SCOP/superfamily
SCOP/family
PFAM
PROSITE
MEMBRANE
SORT
by number of domains
by taxonomy
Other search page
[Advanced Keyword Search]
[Sequence Homology Search]
[Sequence Text Search]
Back to search page
Back to title page